Protein–RNA interactions for Protein: Q61069

Usf1, Upstream stimulatory factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf1Q61069 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usf1Q61069 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usf1Q61069 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usf1Q61069 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usf1Q61069 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usf1Q61069 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usf1Q61069 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usf1Q61069 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usf1Q61069 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usf1Q61069 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usf1Q61069 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usf1Q61069 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usf1Q61069 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Usf1Q61069 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Usf1Q61069 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usf1Q61069 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usf1Q61069 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usf1Q61069 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Usf1Q61069 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usf1Q61069 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usf1Q61069 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Usf1Q61069 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Usf1Q61069 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Usf1Q61069 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Usf1Q61069 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usf1Q61069 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usf1Q61069 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Usf1Q61069 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usf1Q61069 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usf1Q61069 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usf1Q61069 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usf1Q61069 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usf1Q61069 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usf1Q61069 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usf1Q61069 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Usf1Q61069 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usf1Q61069 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usf1Q61069 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usf1Q61069 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usf1Q61069 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usf1Q61069 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usf1Q61069 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Usf1Q61069 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usf1Q61069 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Usf1Q61069 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usf1Q61069 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usf1Q61069 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Usf1Q61069 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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