Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Klf3Q60980 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Klf3Q60980 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms