Protein–RNA interactions for Protein: Q5UBV8

Tnfsf15, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 15, mousemouse

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf15Q5UBV8 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfsf15Q5UBV8 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfsf15Q5UBV8 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfsf15Q5UBV8 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfsf15Q5UBV8 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfsf15Q5UBV8 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfsf15Q5UBV8 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfsf15Q5UBV8 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfsf15Q5UBV8 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfsf15Q5UBV8 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfsf15Q5UBV8 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfsf15Q5UBV8 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfsf15Q5UBV8 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfsf15Q5UBV8 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfsf15Q5UBV8 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfsf15Q5UBV8 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfsf15Q5UBV8 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfsf15Q5UBV8 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfsf15Q5UBV8 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfsf15Q5UBV8 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfsf15Q5UBV8 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfsf15Q5UBV8 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfsf15Q5UBV8 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfsf15Q5UBV8 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfsf15Q5UBV8 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfsf15Q5UBV8 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfsf15Q5UBV8 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfsf15Q5UBV8 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfsf15Q5UBV8 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfsf15Q5UBV8 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfsf15Q5UBV8 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfsf15Q5UBV8 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfsf15Q5UBV8 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfsf15Q5UBV8 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfsf15Q5UBV8 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfsf15Q5UBV8 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfsf15Q5UBV8 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfsf15Q5UBV8 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfsf15Q5UBV8 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfsf15Q5UBV8 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfsf15Q5UBV8 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfsf15Q5UBV8 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfsf15Q5UBV8 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfsf15Q5UBV8 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfsf15Q5UBV8 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfsf15Q5UBV8 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfsf15Q5UBV8 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfsf15Q5UBV8 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfsf15Q5UBV8 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfsf15Q5UBV8 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfsf15Q5UBV8 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfsf15Q5UBV8 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfsf15Q5UBV8 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfsf15Q5UBV8 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfsf15Q5UBV8 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfsf15Q5UBV8 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnfsf15Q5UBV8 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnfsf15Q5UBV8 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnfsf15Q5UBV8 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnfsf15Q5UBV8 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnfsf15Q5UBV8 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnfsf15Q5UBV8 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnfsf15Q5UBV8 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnfsf15Q5UBV8 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnfsf15Q5UBV8 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnfsf15Q5UBV8 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnfsf15Q5UBV8 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnfsf15Q5UBV8 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnfsf15Q5UBV8 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnfsf15Q5UBV8 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnfsf15Q5UBV8 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnfsf15Q5UBV8 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnfsf15Q5UBV8 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnfsf15Q5UBV8 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnfsf15Q5UBV8 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnfsf15Q5UBV8 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnfsf15Q5UBV8 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnfsf15Q5UBV8 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnfsf15Q5UBV8 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnfsf15Q5UBV8 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnfsf15Q5UBV8 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnfsf15Q5UBV8 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnfsf15Q5UBV8 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnfsf15Q5UBV8 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnfsf15Q5UBV8 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnfsf15Q5UBV8 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnfsf15Q5UBV8 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnfsf15Q5UBV8 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnfsf15Q5UBV8 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnfsf15Q5UBV8 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnfsf15Q5UBV8 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnfsf15Q5UBV8 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnfsf15Q5UBV8 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnfsf15Q5UBV8 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnfsf15Q5UBV8 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnfsf15Q5UBV8 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnfsf15Q5UBV8 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnfsf15Q5UBV8 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnfsf15Q5UBV8 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tnfsf15Q5UBV8 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms