Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC9

Trim58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim58Q5NCC9 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim58Q5NCC9 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim58Q5NCC9 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim58Q5NCC9 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim58Q5NCC9 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim58Q5NCC9 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim58Q5NCC9 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim58Q5NCC9 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim58Q5NCC9 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim58Q5NCC9 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim58Q5NCC9 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim58Q5NCC9 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim58Q5NCC9 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim58Q5NCC9 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim58Q5NCC9 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim58Q5NCC9 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim58Q5NCC9 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim58Q5NCC9 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim58Q5NCC9 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim58Q5NCC9 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim58Q5NCC9 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim58Q5NCC9 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim58Q5NCC9 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim58Q5NCC9 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim58Q5NCC9 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim58Q5NCC9 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim58Q5NCC9 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim58Q5NCC9 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim58Q5NCC9 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim58Q5NCC9 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim58Q5NCC9 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim58Q5NCC9 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim58Q5NCC9 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim58Q5NCC9 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim58Q5NCC9 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim58Q5NCC9 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trim58Q5NCC9 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim58Q5NCC9 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim58Q5NCC9 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim58Q5NCC9 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim58Q5NCC9 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim58Q5NCC9 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim58Q5NCC9 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim58Q5NCC9 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim58Q5NCC9 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim58Q5NCC9 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim58Q5NCC9 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim58Q5NCC9 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim58Q5NCC9 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim58Q5NCC9 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim58Q5NCC9 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim58Q5NCC9 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim58Q5NCC9 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim58Q5NCC9 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim58Q5NCC9 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim58Q5NCC9 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim58Q5NCC9 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim58Q5NCC9 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim58Q5NCC9 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim58Q5NCC9 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim58Q5NCC9 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim58Q5NCC9 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim58Q5NCC9 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trim58Q5NCC9 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trim58Q5NCC9 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trim58Q5NCC9 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trim58Q5NCC9 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trim58Q5NCC9 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trim58Q5NCC9 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trim58Q5NCC9 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trim58Q5NCC9 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trim58Q5NCC9 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trim58Q5NCC9 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trim58Q5NCC9 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Trim58Q5NCC9 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Trim58Q5NCC9 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trim58Q5NCC9 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trim58Q5NCC9 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trim58Q5NCC9 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trim58Q5NCC9 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trim58Q5NCC9 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trim58Q5NCC9 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trim58Q5NCC9 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trim58Q5NCC9 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim58Q5NCC9 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim58Q5NCC9 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim58Q5NCC9 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim58Q5NCC9 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim58Q5NCC9 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim58Q5NCC9 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim58Q5NCC9 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim58Q5NCC9 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim58Q5NCC9 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim58Q5NCC9 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim58Q5NCC9 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim58Q5NCC9 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim58Q5NCC9 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim58Q5NCC9 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim58Q5NCC9 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trim58Q5NCC9 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms