Protein–RNA interactions for Protein: Q571H0

Urb1, Nucleolar pre-ribosomal-associated protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,274 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urb1Q571H0 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Urb1Q571H0 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Urb1Q571H0 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Urb1Q571H0 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Urb1Q571H0 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Urb1Q571H0 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Urb1Q571H0 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Urb1Q571H0 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Urb1Q571H0 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Urb1Q571H0 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Urb1Q571H0 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Urb1Q571H0 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Urb1Q571H0 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Urb1Q571H0 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Urb1Q571H0 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Urb1Q571H0 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Urb1Q571H0 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Urb1Q571H0 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Urb1Q571H0 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Urb1Q571H0 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Urb1Q571H0 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Urb1Q571H0 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Urb1Q571H0 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Urb1Q571H0 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Urb1Q571H0 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Urb1Q571H0 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Urb1Q571H0 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Urb1Q571H0 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Urb1Q571H0 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Urb1Q571H0 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Urb1Q571H0 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Urb1Q571H0 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Urb1Q571H0 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Urb1Q571H0 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Urb1Q571H0 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Urb1Q571H0 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Urb1Q571H0 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Urb1Q571H0 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Urb1Q571H0 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Urb1Q571H0 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Urb1Q571H0 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Urb1Q571H0 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Urb1Q571H0 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Urb1Q571H0 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Urb1Q571H0 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Urb1Q571H0 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Urb1Q571H0 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Urb1Q571H0 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Urb1Q571H0 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Urb1Q571H0 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Urb1Q571H0 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Urb1Q571H0 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Urb1Q571H0 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Urb1Q571H0 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Urb1Q571H0 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Urb1Q571H0 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Urb1Q571H0 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Urb1Q571H0 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Urb1Q571H0 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Urb1Q571H0 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Urb1Q571H0 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Urb1Q571H0 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Urb1Q571H0 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Urb1Q571H0 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Urb1Q571H0 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Urb1Q571H0 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Urb1Q571H0 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Urb1Q571H0 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Urb1Q571H0 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Urb1Q571H0 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Urb1Q571H0 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Urb1Q571H0 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Urb1Q571H0 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Urb1Q571H0 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Urb1Q571H0 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Urb1Q571H0 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Urb1Q571H0 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Urb1Q571H0 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Urb1Q571H0 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Urb1Q571H0 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Urb1Q571H0 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Urb1Q571H0 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Urb1Q571H0 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Urb1Q571H0 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Urb1Q571H0 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Urb1Q571H0 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Urb1Q571H0 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Urb1Q571H0 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Urb1Q571H0 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Urb1Q571H0 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Urb1Q571H0 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Urb1Q571H0 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Urb1Q571H0 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Urb1Q571H0 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Urb1Q571H0 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Urb1Q571H0 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Urb1Q571H0 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Urb1Q571H0 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Urb1Q571H0 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Urb1Q571H0 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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