Protein–RNA interactions for Protein: Q3V061

Trim80, Tripartite motif-containing 80, mousemouse

Predictions only

Length 624 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim80Q3V061 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim80Q3V061 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim80Q3V061 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim80Q3V061 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim80Q3V061 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim80Q3V061 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim80Q3V061 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim80Q3V061 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim80Q3V061 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim80Q3V061 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim80Q3V061 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim80Q3V061 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim80Q3V061 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim80Q3V061 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim80Q3V061 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim80Q3V061 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim80Q3V061 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim80Q3V061 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim80Q3V061 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim80Q3V061 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim80Q3V061 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim80Q3V061 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim80Q3V061 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim80Q3V061 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim80Q3V061 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim80Q3V061 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim80Q3V061 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim80Q3V061 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim80Q3V061 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trim80Q3V061 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Trim80Q3V061 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim80Q3V061 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim80Q3V061 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim80Q3V061 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim80Q3V061 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim80Q3V061 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim80Q3V061 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim80Q3V061 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Trim80Q3V061 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim80Q3V061 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim80Q3V061 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim80Q3V061 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim80Q3V061 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim80Q3V061 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim80Q3V061 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim80Q3V061 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim80Q3V061 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim80Q3V061 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim80Q3V061 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim80Q3V061 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim80Q3V061 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim80Q3V061 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim80Q3V061 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim80Q3V061 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim80Q3V061 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trim80Q3V061 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim80Q3V061 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Trim80Q3V061 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim80Q3V061 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim80Q3V061 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim80Q3V061 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim80Q3V061 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim80Q3V061 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim80Q3V061 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim80Q3V061 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim80Q3V061 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim80Q3V061 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim80Q3V061 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim80Q3V061 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim80Q3V061 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim80Q3V061 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim80Q3V061 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim80Q3V061 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim80Q3V061 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim80Q3V061 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim80Q3V061 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim80Q3V061 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim80Q3V061 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim80Q3V061 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim80Q3V061 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim80Q3V061 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim80Q3V061 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim80Q3V061 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trim80Q3V061 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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