Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ39

Lrrfip1, Leucine-rich repeat flightless-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrfip1Q3UZ39 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrfip1Q3UZ39 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrfip1Q3UZ39 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrfip1Q3UZ39 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrfip1Q3UZ39 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrfip1Q3UZ39 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrfip1Q3UZ39 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrfip1Q3UZ39 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrfip1Q3UZ39 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrfip1Q3UZ39 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrfip1Q3UZ39 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrfip1Q3UZ39 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrfip1Q3UZ39 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrfip1Q3UZ39 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrfip1Q3UZ39 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrfip1Q3UZ39 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrfip1Q3UZ39 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrfip1Q3UZ39 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrfip1Q3UZ39 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrfip1Q3UZ39 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrfip1Q3UZ39 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrfip1Q3UZ39 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrfip1Q3UZ39 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrfip1Q3UZ39 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrfip1Q3UZ39 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrfip1Q3UZ39 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrfip1Q3UZ39 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrfip1Q3UZ39 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrfip1Q3UZ39 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrfip1Q3UZ39 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrfip1Q3UZ39 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrfip1Q3UZ39 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrfip1Q3UZ39 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrfip1Q3UZ39 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrfip1Q3UZ39 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrfip1Q3UZ39 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrfip1Q3UZ39 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrfip1Q3UZ39 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrfip1Q3UZ39 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrfip1Q3UZ39 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrfip1Q3UZ39 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrfip1Q3UZ39 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrfip1Q3UZ39 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrfip1Q3UZ39 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrfip1Q3UZ39 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrfip1Q3UZ39 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrfip1Q3UZ39 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrfip1Q3UZ39 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrfip1Q3UZ39 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrfip1Q3UZ39 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrfip1Q3UZ39 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrfip1Q3UZ39 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrfip1Q3UZ39 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrfip1Q3UZ39 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrfip1Q3UZ39 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrfip1Q3UZ39 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrfip1Q3UZ39 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrfip1Q3UZ39 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrfip1Q3UZ39 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrfip1Q3UZ39 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrfip1Q3UZ39 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrfip1Q3UZ39 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrfip1Q3UZ39 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrfip1Q3UZ39 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrfip1Q3UZ39 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrfip1Q3UZ39 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrfip1Q3UZ39 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrfip1Q3UZ39 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrfip1Q3UZ39 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrfip1Q3UZ39 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrfip1Q3UZ39 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrfip1Q3UZ39 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrfip1Q3UZ39 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrfip1Q3UZ39 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrfip1Q3UZ39 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrfip1Q3UZ39 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrfip1Q3UZ39 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrfip1Q3UZ39 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrfip1Q3UZ39 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrfip1Q3UZ39 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrfip1Q3UZ39 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrfip1Q3UZ39 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrfip1Q3UZ39 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrfip1Q3UZ39 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrfip1Q3UZ39 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrfip1Q3UZ39 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrfip1Q3UZ39 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrfip1Q3UZ39 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrfip1Q3UZ39 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrfip1Q3UZ39 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrfip1Q3UZ39 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrfip1Q3UZ39 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrfip1Q3UZ39 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrfip1Q3UZ39 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrfip1Q3UZ39 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrfip1Q3UZ39 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrfip1Q3UZ39 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrfip1Q3UZ39 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrfip1Q3UZ39 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrfip1Q3UZ39 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms