Protein–RNA interactions for Protein: Q3UX43

Ankrd13c, Ankyrin repeat domain-containing protein 13C, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd13cQ3UX43 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ankrd13cQ3UX43 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ankrd13cQ3UX43 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ankrd13cQ3UX43 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ankrd13cQ3UX43 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ankrd13cQ3UX43 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ankrd13cQ3UX43 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ankrd13cQ3UX43 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ankrd13cQ3UX43 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ankrd13cQ3UX43 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ankrd13cQ3UX43 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ankrd13cQ3UX43 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ankrd13cQ3UX43 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ankrd13cQ3UX43 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ankrd13cQ3UX43 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ankrd13cQ3UX43 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ankrd13cQ3UX43 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ankrd13cQ3UX43 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ankrd13cQ3UX43 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ankrd13cQ3UX43 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ankrd13cQ3UX43 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ankrd13cQ3UX43 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ankrd13cQ3UX43 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ankrd13cQ3UX43 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ankrd13cQ3UX43 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ankrd13cQ3UX43 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ankrd13cQ3UX43 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ankrd13cQ3UX43 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ankrd13cQ3UX43 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ankrd13cQ3UX43 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ankrd13cQ3UX43 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ankrd13cQ3UX43 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ankrd13cQ3UX43 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ankrd13cQ3UX43 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ankrd13cQ3UX43 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ankrd13cQ3UX43 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ankrd13cQ3UX43 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ankrd13cQ3UX43 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ankrd13cQ3UX43 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ankrd13cQ3UX43 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ankrd13cQ3UX43 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ankrd13cQ3UX43 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ankrd13cQ3UX43 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ankrd13cQ3UX43 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ankrd13cQ3UX43 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ankrd13cQ3UX43 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ankrd13cQ3UX43 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ankrd13cQ3UX43 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ankrd13cQ3UX43 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ankrd13cQ3UX43 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ankrd13cQ3UX43 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ankrd13cQ3UX43 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ankrd13cQ3UX43 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ankrd13cQ3UX43 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ankrd13cQ3UX43 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ankrd13cQ3UX43 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ankrd13cQ3UX43 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ankrd13cQ3UX43 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ankrd13cQ3UX43 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ankrd13cQ3UX43 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ankrd13cQ3UX43 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ankrd13cQ3UX43 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ankrd13cQ3UX43 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ankrd13cQ3UX43 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ankrd13cQ3UX43 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ankrd13cQ3UX43 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ankrd13cQ3UX43 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ankrd13cQ3UX43 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ankrd13cQ3UX43 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ankrd13cQ3UX43 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ankrd13cQ3UX43 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ankrd13cQ3UX43 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ankrd13cQ3UX43 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ankrd13cQ3UX43 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ankrd13cQ3UX43 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ankrd13cQ3UX43 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ankrd13cQ3UX43 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ankrd13cQ3UX43 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ankrd13cQ3UX43 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ankrd13cQ3UX43 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ankrd13cQ3UX43 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ankrd13cQ3UX43 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ankrd13cQ3UX43 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ankrd13cQ3UX43 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ankrd13cQ3UX43 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ankrd13cQ3UX43 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ankrd13cQ3UX43 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ankrd13cQ3UX43 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ankrd13cQ3UX43 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ankrd13cQ3UX43 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ankrd13cQ3UX43 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ankrd13cQ3UX43 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ankrd13cQ3UX43 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ankrd13cQ3UX43 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ankrd13cQ3UX43 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ankrd13cQ3UX43 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ankrd13cQ3UX43 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ankrd13cQ3UX43 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ankrd13cQ3UX43 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ankrd13cQ3UX43 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms