Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV7

Zfp953, Zinc finger protein 953, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp953Q3UPV7 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp953Q3UPV7 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp953Q3UPV7 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp953Q3UPV7 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp953Q3UPV7 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp953Q3UPV7 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp953Q3UPV7 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp953Q3UPV7 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp953Q3UPV7 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp953Q3UPV7 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp953Q3UPV7 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp953Q3UPV7 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp953Q3UPV7 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp953Q3UPV7 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp953Q3UPV7 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp953Q3UPV7 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp953Q3UPV7 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp953Q3UPV7 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp953Q3UPV7 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp953Q3UPV7 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp953Q3UPV7 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp953Q3UPV7 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp953Q3UPV7 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp953Q3UPV7 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp953Q3UPV7 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp953Q3UPV7 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp953Q3UPV7 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp953Q3UPV7 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp953Q3UPV7 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp953Q3UPV7 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp953Q3UPV7 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp953Q3UPV7 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp953Q3UPV7 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp953Q3UPV7 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp953Q3UPV7 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp953Q3UPV7 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Zfp953Q3UPV7 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Zfp953Q3UPV7 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Zfp953Q3UPV7 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp953Q3UPV7 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp953Q3UPV7 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp953Q3UPV7 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp953Q3UPV7 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp953Q3UPV7 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp953Q3UPV7 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp953Q3UPV7 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp953Q3UPV7 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp953Q3UPV7 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp953Q3UPV7 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp953Q3UPV7 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp953Q3UPV7 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp953Q3UPV7 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp953Q3UPV7 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp953Q3UPV7 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zfp953Q3UPV7 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp953Q3UPV7 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp953Q3UPV7 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp953Q3UPV7 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp953Q3UPV7 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp953Q3UPV7 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp953Q3UPV7 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp953Q3UPV7 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp953Q3UPV7 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp953Q3UPV7 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp953Q3UPV7 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp953Q3UPV7 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp953Q3UPV7 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp953Q3UPV7 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp953Q3UPV7 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp953Q3UPV7 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp953Q3UPV7 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp953Q3UPV7 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp953Q3UPV7 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp953Q3UPV7 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp953Q3UPV7 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp953Q3UPV7 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp953Q3UPV7 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp953Q3UPV7 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp953Q3UPV7 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp953Q3UPV7 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp953Q3UPV7 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp953Q3UPV7 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp953Q3UPV7 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp953Q3UPV7 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp953Q3UPV7 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp953Q3UPV7 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp953Q3UPV7 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp953Q3UPV7 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp953Q3UPV7 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp953Q3UPV7 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp953Q3UPV7 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp953Q3UPV7 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp953Q3UPV7 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp953Q3UPV7 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp953Q3UPV7 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp953Q3UPV7 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp953Q3UPV7 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp953Q3UPV7 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp953Q3UPV7 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp953Q3UPV7 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms