Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPL0

Sec31a, Protein transport protein Sec31A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec31aQ3UPL0 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sec31aQ3UPL0 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sec31aQ3UPL0 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sec31aQ3UPL0 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sec31aQ3UPL0 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sec31aQ3UPL0 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sec31aQ3UPL0 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sec31aQ3UPL0 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sec31aQ3UPL0 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sec31aQ3UPL0 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sec31aQ3UPL0 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sec31aQ3UPL0 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Sec31aQ3UPL0 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sec31aQ3UPL0 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sec31aQ3UPL0 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sec31aQ3UPL0 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sec31aQ3UPL0 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sec31aQ3UPL0 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sec31aQ3UPL0 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sec31aQ3UPL0 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sec31aQ3UPL0 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sec31aQ3UPL0 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sec31aQ3UPL0 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sec31aQ3UPL0 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sec31aQ3UPL0 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sec31aQ3UPL0 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sec31aQ3UPL0 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sec31aQ3UPL0 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sec31aQ3UPL0 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sec31aQ3UPL0 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sec31aQ3UPL0 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sec31aQ3UPL0 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Sec31aQ3UPL0 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sec31aQ3UPL0 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sec31aQ3UPL0 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sec31aQ3UPL0 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Sec31aQ3UPL0 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Sec31aQ3UPL0 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sec31aQ3UPL0 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Sec31aQ3UPL0 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Sec31aQ3UPL0 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sec31aQ3UPL0 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sec31aQ3UPL0 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sec31aQ3UPL0 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Sec31aQ3UPL0 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sec31aQ3UPL0 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sec31aQ3UPL0 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sec31aQ3UPL0 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sec31aQ3UPL0 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sec31aQ3UPL0 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sec31aQ3UPL0 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sec31aQ3UPL0 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sec31aQ3UPL0 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sec31aQ3UPL0 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sec31aQ3UPL0 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sec31aQ3UPL0 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sec31aQ3UPL0 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sec31aQ3UPL0 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sec31aQ3UPL0 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sec31aQ3UPL0 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sec31aQ3UPL0 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sec31aQ3UPL0 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sec31aQ3UPL0 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sec31aQ3UPL0 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sec31aQ3UPL0 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sec31aQ3UPL0 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Sec31aQ3UPL0 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sec31aQ3UPL0 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sec31aQ3UPL0 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sec31aQ3UPL0 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sec31aQ3UPL0 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sec31aQ3UPL0 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sec31aQ3UPL0 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sec31aQ3UPL0 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sec31aQ3UPL0 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sec31aQ3UPL0 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sec31aQ3UPL0 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sec31aQ3UPL0 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sec31aQ3UPL0 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sec31aQ3UPL0 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sec31aQ3UPL0 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sec31aQ3UPL0 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sec31aQ3UPL0 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sec31aQ3UPL0 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sec31aQ3UPL0 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sec31aQ3UPL0 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sec31aQ3UPL0 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sec31aQ3UPL0 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sec31aQ3UPL0 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sec31aQ3UPL0 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sec31aQ3UPL0 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sec31aQ3UPL0 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sec31aQ3UPL0 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sec31aQ3UPL0 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sec31aQ3UPL0 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sec31aQ3UPL0 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sec31aQ3UPL0 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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