Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc34Q3UI66 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc34Q3UI66 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc34Q3UI66 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc34Q3UI66 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc34Q3UI66 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc34Q3UI66 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc34Q3UI66 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc34Q3UI66 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc34Q3UI66 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc34Q3UI66 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc34Q3UI66 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc34Q3UI66 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc34Q3UI66 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc34Q3UI66 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc34Q3UI66 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc34Q3UI66 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc34Q3UI66 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc34Q3UI66 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc34Q3UI66 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc34Q3UI66 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc34Q3UI66 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc34Q3UI66 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc34Q3UI66 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc34Q3UI66 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc34Q3UI66 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc34Q3UI66 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc34Q3UI66 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc34Q3UI66 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc34Q3UI66 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc34Q3UI66 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc34Q3UI66 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc34Q3UI66 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc34Q3UI66 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc34Q3UI66 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc34Q3UI66 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc34Q3UI66 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc34Q3UI66 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc34Q3UI66 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc34Q3UI66 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc34Q3UI66 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc34Q3UI66 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc34Q3UI66 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc34Q3UI66 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc34Q3UI66 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc34Q3UI66 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc34Q3UI66 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc34Q3UI66 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc34Q3UI66 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc34Q3UI66 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc34Q3UI66 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc34Q3UI66 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc34Q3UI66 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc34Q3UI66 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc34Q3UI66 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc34Q3UI66 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc34Q3UI66 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc34Q3UI66 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc34Q3UI66 Gm43936-201ENSMUST00000203987 490 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc34Q3UI66 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc34Q3UI66 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc34Q3UI66 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc34Q3UI66 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc34Q3UI66 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc34Q3UI66 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc34Q3UI66 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc34Q3UI66 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc34Q3UI66 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc34Q3UI66 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc34Q3UI66 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc34Q3UI66 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc34Q3UI66 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc34Q3UI66 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc34Q3UI66 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc34Q3UI66 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc34Q3UI66 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc34Q3UI66 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc34Q3UI66 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc34Q3UI66 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc34Q3UI66 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc34Q3UI66 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc34Q3UI66 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc34Q3UI66 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc34Q3UI66 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc34Q3UI66 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc34Q3UI66 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc34Q3UI66 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc34Q3UI66 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc34Q3UI66 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc34Q3UI66 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc34Q3UI66 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc34Q3UI66 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc34Q3UI66 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc34Q3UI66 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc34Q3UI66 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc34Q3UI66 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc34Q3UI66 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc34Q3UI66 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc34Q3UI66 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc34Q3UI66 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms