Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q3U6N9 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Q3U6N9 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q3U6N9 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Q3U6N9 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Q3U6N9 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Q3U6N9 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q3U6N9 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q3U6N9 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q3U6N9 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q3U6N9 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q3U6N9 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q3U6N9 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Q3U6N9 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q3U6N9 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Q3U6N9 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q3U6N9 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Q3U6N9 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q3U6N9 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q3U6N9 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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