Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2S4

Otud5, OTU domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud5Q3U2S4 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Otud5Q3U2S4 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Otud5Q3U2S4 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Otud5Q3U2S4 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Otud5Q3U2S4 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Otud5Q3U2S4 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Otud5Q3U2S4 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Otud5Q3U2S4 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Otud5Q3U2S4 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Otud5Q3U2S4 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Otud5Q3U2S4 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Otud5Q3U2S4 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Otud5Q3U2S4 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
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Otud5Q3U2S4 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Otud5Q3U2S4 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Otud5Q3U2S4 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Otud5Q3U2S4 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Otud5Q3U2S4 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Otud5Q3U2S4 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Otud5Q3U2S4 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Otud5Q3U2S4 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Otud5Q3U2S4 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Otud5Q3U2S4 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Otud5Q3U2S4 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Otud5Q3U2S4 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Otud5Q3U2S4 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Otud5Q3U2S4 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Otud5Q3U2S4 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Otud5Q3U2S4 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Otud5Q3U2S4 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Otud5Q3U2S4 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Otud5Q3U2S4 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Otud5Q3U2S4 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Otud5Q3U2S4 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Otud5Q3U2S4 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Otud5Q3U2S4 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Otud5Q3U2S4 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Otud5Q3U2S4 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Otud5Q3U2S4 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Otud5Q3U2S4 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Otud5Q3U2S4 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Otud5Q3U2S4 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Otud5Q3U2S4 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Otud5Q3U2S4 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Otud5Q3U2S4 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Otud5Q3U2S4 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Otud5Q3U2S4 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Otud5Q3U2S4 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Otud5Q3U2S4 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Otud5Q3U2S4 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Otud5Q3U2S4 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Otud5Q3U2S4 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Otud5Q3U2S4 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Otud5Q3U2S4 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Otud5Q3U2S4 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Otud5Q3U2S4 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Otud5Q3U2S4 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Otud5Q3U2S4 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Otud5Q3U2S4 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Otud5Q3U2S4 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Otud5Q3U2S4 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Otud5Q3U2S4 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Otud5Q3U2S4 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Otud5Q3U2S4 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Otud5Q3U2S4 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Otud5Q3U2S4 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Otud5Q3U2S4 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Otud5Q3U2S4 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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