Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0V1

Khsrp, Far upstream element-binding protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 748 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KhsrpQ3U0V1 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KhsrpQ3U0V1 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KhsrpQ3U0V1 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KhsrpQ3U0V1 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KhsrpQ3U0V1 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KhsrpQ3U0V1 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KhsrpQ3U0V1 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KhsrpQ3U0V1 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KhsrpQ3U0V1 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KhsrpQ3U0V1 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
KhsrpQ3U0V1 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KhsrpQ3U0V1 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KhsrpQ3U0V1 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KhsrpQ3U0V1 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
KhsrpQ3U0V1 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
KhsrpQ3U0V1 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KhsrpQ3U0V1 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KhsrpQ3U0V1 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KhsrpQ3U0V1 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KhsrpQ3U0V1 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KhsrpQ3U0V1 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KhsrpQ3U0V1 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KhsrpQ3U0V1 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KhsrpQ3U0V1 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KhsrpQ3U0V1 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KhsrpQ3U0V1 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KhsrpQ3U0V1 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KhsrpQ3U0V1 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KhsrpQ3U0V1 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KhsrpQ3U0V1 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KhsrpQ3U0V1 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KhsrpQ3U0V1 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KhsrpQ3U0V1 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KhsrpQ3U0V1 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KhsrpQ3U0V1 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KhsrpQ3U0V1 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KhsrpQ3U0V1 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
KhsrpQ3U0V1 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
KhsrpQ3U0V1 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KhsrpQ3U0V1 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KhsrpQ3U0V1 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KhsrpQ3U0V1 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KhsrpQ3U0V1 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KhsrpQ3U0V1 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KhsrpQ3U0V1 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KhsrpQ3U0V1 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
KhsrpQ3U0V1 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
KhsrpQ3U0V1 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
KhsrpQ3U0V1 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
KhsrpQ3U0V1 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KhsrpQ3U0V1 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KhsrpQ3U0V1 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KhsrpQ3U0V1 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KhsrpQ3U0V1 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KhsrpQ3U0V1 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KhsrpQ3U0V1 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KhsrpQ3U0V1 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KhsrpQ3U0V1 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KhsrpQ3U0V1 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KhsrpQ3U0V1 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KhsrpQ3U0V1 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KhsrpQ3U0V1 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KhsrpQ3U0V1 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KhsrpQ3U0V1 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KhsrpQ3U0V1 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KhsrpQ3U0V1 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KhsrpQ3U0V1 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
KhsrpQ3U0V1 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KhsrpQ3U0V1 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KhsrpQ3U0V1 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KhsrpQ3U0V1 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KhsrpQ3U0V1 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KhsrpQ3U0V1 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
KhsrpQ3U0V1 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KhsrpQ3U0V1 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KhsrpQ3U0V1 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
KhsrpQ3U0V1 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
KhsrpQ3U0V1 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
KhsrpQ3U0V1 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KhsrpQ3U0V1 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KhsrpQ3U0V1 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
KhsrpQ3U0V1 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
KhsrpQ3U0V1 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
KhsrpQ3U0V1 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KhsrpQ3U0V1 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KhsrpQ3U0V1 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KhsrpQ3U0V1 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KhsrpQ3U0V1 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KhsrpQ3U0V1 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KhsrpQ3U0V1 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KhsrpQ3U0V1 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KhsrpQ3U0V1 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KhsrpQ3U0V1 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KhsrpQ3U0V1 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KhsrpQ3U0V1 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
KhsrpQ3U0V1 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KhsrpQ3U0V1 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KhsrpQ3U0V1 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KhsrpQ3U0V1 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
KhsrpQ3U0V1 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms