Protein–RNA interactions for Protein: Q3TBN1

Tmem248, Transmembrane protein 248, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem248Q3TBN1 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tmem248Q3TBN1 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmem248Q3TBN1 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmem248Q3TBN1 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmem248Q3TBN1 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmem248Q3TBN1 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmem248Q3TBN1 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmem248Q3TBN1 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmem248Q3TBN1 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmem248Q3TBN1 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmem248Q3TBN1 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmem248Q3TBN1 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmem248Q3TBN1 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmem248Q3TBN1 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmem248Q3TBN1 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmem248Q3TBN1 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmem248Q3TBN1 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmem248Q3TBN1 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmem248Q3TBN1 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmem248Q3TBN1 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmem248Q3TBN1 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmem248Q3TBN1 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmem248Q3TBN1 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmem248Q3TBN1 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms