Protein–RNA interactions for Protein: Q149B8

Perm1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 807 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Perm1Q149B8 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Perm1Q149B8 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
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Perm1Q149B8 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
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Perm1Q149B8 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Perm1Q149B8 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Perm1Q149B8 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Perm1Q149B8 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Perm1Q149B8 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Perm1Q149B8 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Perm1Q149B8 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
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Perm1Q149B8 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
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Perm1Q149B8 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Perm1Q149B8 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Perm1Q149B8 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Perm1Q149B8 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
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Perm1Q149B8 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
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Perm1Q149B8 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Perm1Q149B8 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
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Perm1Q149B8 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
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Perm1Q149B8 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Perm1Q149B8 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Perm1Q149B8 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
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Perm1Q149B8 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Perm1Q149B8 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Perm1Q149B8 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Perm1Q149B8 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Perm1Q149B8 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Perm1Q149B8 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Perm1Q149B8 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Perm1Q149B8 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Perm1Q149B8 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Perm1Q149B8 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Perm1Q149B8 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Perm1Q149B8 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Perm1Q149B8 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Perm1Q149B8 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Perm1Q149B8 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Perm1Q149B8 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Perm1Q149B8 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Perm1Q149B8 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.1 ms