Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TrioQ0KL02 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TrioQ0KL02 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TrioQ0KL02 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TrioQ0KL02 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
TrioQ0KL02 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TrioQ0KL02 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TrioQ0KL02 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
TrioQ0KL02 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TrioQ0KL02 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TrioQ0KL02 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TrioQ0KL02 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TrioQ0KL02 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
TrioQ0KL02 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TrioQ0KL02 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TrioQ0KL02 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TrioQ0KL02 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TrioQ0KL02 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TrioQ0KL02 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TrioQ0KL02 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
TrioQ0KL02 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
TrioQ0KL02 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
TrioQ0KL02 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TrioQ0KL02 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TrioQ0KL02 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
TrioQ0KL02 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
TrioQ0KL02 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TrioQ0KL02 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TrioQ0KL02 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TrioQ0KL02 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TrioQ0KL02 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
TrioQ0KL02 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TrioQ0KL02 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TrioQ0KL02 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TrioQ0KL02 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TrioQ0KL02 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TrioQ0KL02 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TrioQ0KL02 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TrioQ0KL02 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TrioQ0KL02 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
TrioQ0KL02 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
TrioQ0KL02 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TrioQ0KL02 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TrioQ0KL02 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TrioQ0KL02 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TrioQ0KL02 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TrioQ0KL02 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TrioQ0KL02 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TrioQ0KL02 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TrioQ0KL02 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TrioQ0KL02 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TrioQ0KL02 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TrioQ0KL02 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
TrioQ0KL02 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
TrioQ0KL02 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TrioQ0KL02 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TrioQ0KL02 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
TrioQ0KL02 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TrioQ0KL02 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TrioQ0KL02 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TrioQ0KL02 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TrioQ0KL02 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TrioQ0KL02 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TrioQ0KL02 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TrioQ0KL02 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TrioQ0KL02 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TrioQ0KL02 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TrioQ0KL02 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TrioQ0KL02 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TrioQ0KL02 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TrioQ0KL02 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TrioQ0KL02 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TrioQ0KL02 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
TrioQ0KL02 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
TrioQ0KL02 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TrioQ0KL02 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
TrioQ0KL02 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TrioQ0KL02 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
TrioQ0KL02 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
TrioQ0KL02 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TrioQ0KL02 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
TrioQ0KL02 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TrioQ0KL02 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
TrioQ0KL02 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TrioQ0KL02 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TrioQ0KL02 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
TrioQ0KL02 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
TrioQ0KL02 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TrioQ0KL02 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
TrioQ0KL02 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
TrioQ0KL02 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
TrioQ0KL02 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TrioQ0KL02 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TrioQ0KL02 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TrioQ0KL02 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TrioQ0KL02 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TrioQ0KL02 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TrioQ0KL02 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TrioQ0KL02 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TrioQ0KL02 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms