Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ubxn2bQ0KL01 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ubxn2bQ0KL01 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ubxn2bQ0KL01 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ubxn2bQ0KL01 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ubxn2bQ0KL01 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ubxn2bQ0KL01 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ubxn2bQ0KL01 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ubxn2bQ0KL01 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ubxn2bQ0KL01 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Ubxn2bQ0KL01 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ubxn2bQ0KL01 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ubxn2bQ0KL01 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ubxn2bQ0KL01 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ubxn2bQ0KL01 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ubxn2bQ0KL01 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ubxn2bQ0KL01 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ubxn2bQ0KL01 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ubxn2bQ0KL01 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ubxn2bQ0KL01 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ubxn2bQ0KL01 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Ubxn2bQ0KL01 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Ubxn2bQ0KL01 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Ubxn2bQ0KL01 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ubxn2bQ0KL01 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ubxn2bQ0KL01 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Ubxn2bQ0KL01 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ubxn2bQ0KL01 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Ubxn2bQ0KL01 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ubxn2bQ0KL01 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ubxn2bQ0KL01 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ubxn2bQ0KL01 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ubxn2bQ0KL01 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ubxn2bQ0KL01 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ubxn2bQ0KL01 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ubxn2bQ0KL01 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ubxn2bQ0KL01 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ubxn2bQ0KL01 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ubxn2bQ0KL01 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ubxn2bQ0KL01 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ubxn2bQ0KL01 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ubxn2bQ0KL01 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ubxn2bQ0KL01 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Ubxn2bQ0KL01 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Ubxn2bQ0KL01 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ubxn2bQ0KL01 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ubxn2bQ0KL01 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ubxn2bQ0KL01 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Ubxn2bQ0KL01 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ubxn2bQ0KL01 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ubxn2bQ0KL01 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Ubxn2bQ0KL01 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ubxn2bQ0KL01 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ubxn2bQ0KL01 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ubxn2bQ0KL01 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ubxn2bQ0KL01 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Ubxn2bQ0KL01 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ubxn2bQ0KL01 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ubxn2bQ0KL01 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ubxn2bQ0KL01 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ubxn2bQ0KL01 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ubxn2bQ0KL01 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ubxn2bQ0KL01 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ubxn2bQ0KL01 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ubxn2bQ0KL01 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ubxn2bQ0KL01 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ubxn2bQ0KL01 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ubxn2bQ0KL01 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ubxn2bQ0KL01 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ubxn2bQ0KL01 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ubxn2bQ0KL01 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ubxn2bQ0KL01 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ubxn2bQ0KL01 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ubxn2bQ0KL01 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ubxn2bQ0KL01 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ubxn2bQ0KL01 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ubxn2bQ0KL01 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ubxn2bQ0KL01 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ubxn2bQ0KL01 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ubxn2bQ0KL01 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ubxn2bQ0KL01 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ubxn2bQ0KL01 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ubxn2bQ0KL01 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ubxn2bQ0KL01 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ubxn2bQ0KL01 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ubxn2bQ0KL01 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ubxn2bQ0KL01 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ubxn2bQ0KL01 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ubxn2bQ0KL01 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ubxn2bQ0KL01 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ubxn2bQ0KL01 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ubxn2bQ0KL01 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ubxn2bQ0KL01 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ubxn2bQ0KL01 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ubxn2bQ0KL01 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ubxn2bQ0KL01 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ubxn2bQ0KL01 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ubxn2bQ0KL01 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ubxn2bQ0KL01 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ubxn2bQ0KL01 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms