Protein–RNA interactions for Protein: Q08EE8

1700061G19Rik, RIKEN cDNA 1700061G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700061G19RikQ08EE8 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
1700061G19RikQ08EE8 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
1700061G19RikQ08EE8 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
1700061G19RikQ08EE8 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
1700061G19RikQ08EE8 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
1700061G19RikQ08EE8 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
1700061G19RikQ08EE8 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
1700061G19RikQ08EE8 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
1700061G19RikQ08EE8 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
1700061G19RikQ08EE8 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
1700061G19RikQ08EE8 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
1700061G19RikQ08EE8 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
1700061G19RikQ08EE8 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
1700061G19RikQ08EE8 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
1700061G19RikQ08EE8 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
1700061G19RikQ08EE8 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
1700061G19RikQ08EE8 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
1700061G19RikQ08EE8 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
1700061G19RikQ08EE8 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
1700061G19RikQ08EE8 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.11
1700061G19RikQ08EE8 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
1700061G19RikQ08EE8 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
1700061G19RikQ08EE8 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC14.33□□□□□ -0.11
1700061G19RikQ08EE8 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
1700061G19RikQ08EE8 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
1700061G19RikQ08EE8 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
1700061G19RikQ08EE8 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
1700061G19RikQ08EE8 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
1700061G19RikQ08EE8 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
1700061G19RikQ08EE8 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
1700061G19RikQ08EE8 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
1700061G19RikQ08EE8 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
1700061G19RikQ08EE8 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
1700061G19RikQ08EE8 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
1700061G19RikQ08EE8 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
1700061G19RikQ08EE8 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
1700061G19RikQ08EE8 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
1700061G19RikQ08EE8 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
1700061G19RikQ08EE8 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
1700061G19RikQ08EE8 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
1700061G19RikQ08EE8 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
1700061G19RikQ08EE8 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
1700061G19RikQ08EE8 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
1700061G19RikQ08EE8 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
1700061G19RikQ08EE8 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
1700061G19RikQ08EE8 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
1700061G19RikQ08EE8 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
1700061G19RikQ08EE8 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
1700061G19RikQ08EE8 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
1700061G19RikQ08EE8 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
1700061G19RikQ08EE8 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
1700061G19RikQ08EE8 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
1700061G19RikQ08EE8 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
1700061G19RikQ08EE8 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
1700061G19RikQ08EE8 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
1700061G19RikQ08EE8 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
1700061G19RikQ08EE8 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
1700061G19RikQ08EE8 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
1700061G19RikQ08EE8 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
1700061G19RikQ08EE8 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
1700061G19RikQ08EE8 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
1700061G19RikQ08EE8 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
1700061G19RikQ08EE8 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
1700061G19RikQ08EE8 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
1700061G19RikQ08EE8 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
1700061G19RikQ08EE8 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
1700061G19RikQ08EE8 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
1700061G19RikQ08EE8 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
1700061G19RikQ08EE8 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
1700061G19RikQ08EE8 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
1700061G19RikQ08EE8 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
1700061G19RikQ08EE8 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
1700061G19RikQ08EE8 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
1700061G19RikQ08EE8 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
1700061G19RikQ08EE8 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
1700061G19RikQ08EE8 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
1700061G19RikQ08EE8 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
1700061G19RikQ08EE8 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
1700061G19RikQ08EE8 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
1700061G19RikQ08EE8 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
1700061G19RikQ08EE8 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
1700061G19RikQ08EE8 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
1700061G19RikQ08EE8 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
1700061G19RikQ08EE8 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
1700061G19RikQ08EE8 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
1700061G19RikQ08EE8 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
1700061G19RikQ08EE8 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
1700061G19RikQ08EE8 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
1700061G19RikQ08EE8 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
1700061G19RikQ08EE8 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
1700061G19RikQ08EE8 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
1700061G19RikQ08EE8 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
1700061G19RikQ08EE8 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
1700061G19RikQ08EE8 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
1700061G19RikQ08EE8 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
1700061G19RikQ08EE8 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
1700061G19RikQ08EE8 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
1700061G19RikQ08EE8 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
1700061G19RikQ08EE8 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
1700061G19RikQ08EE8 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109.4 ms