Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Siah1bQ06985 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Siah1bQ06985 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Siah1bQ06985 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Siah1bQ06985 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Siah1bQ06985 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Siah1bQ06985 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Siah1bQ06985 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Siah1bQ06985 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Siah1bQ06985 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Siah1bQ06985 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Siah1bQ06985 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Siah1bQ06985 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Siah1bQ06985 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Siah1bQ06985 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Siah1bQ06985 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Siah1bQ06985 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Siah1bQ06985 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Siah1bQ06985 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Siah1bQ06985 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Siah1bQ06985 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Siah1bQ06985 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Siah1bQ06985 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Siah1bQ06985 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Siah1bQ06985 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Siah1bQ06985 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Siah1bQ06985 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Siah1bQ06985 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Siah1bQ06985 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Siah1bQ06985 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Siah1bQ06985 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Siah1bQ06985 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Siah1bQ06985 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Siah1bQ06985 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Siah1bQ06985 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Siah1bQ06985 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Siah1bQ06985 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Siah1bQ06985 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Siah1bQ06985 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Siah1bQ06985 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Siah1bQ06985 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Siah1bQ06985 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Siah1bQ06985 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Siah1bQ06985 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Siah1bQ06985 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Siah1bQ06985 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Siah1bQ06985 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Siah1bQ06985 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Siah1bQ06985 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Siah1bQ06985 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Siah1bQ06985 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Siah1bQ06985 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Siah1bQ06985 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Siah1bQ06985 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Siah1bQ06985 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Siah1bQ06985 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Siah1bQ06985 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Siah1bQ06985 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Siah1bQ06985 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Siah1bQ06985 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Siah1bQ06985 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Siah1bQ06985 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Siah1bQ06985 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Siah1bQ06985 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Siah1bQ06985 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Siah1bQ06985 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Siah1bQ06985 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Siah1bQ06985 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Siah1bQ06985 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Siah1bQ06985 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Siah1bQ06985 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Siah1bQ06985 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Siah1bQ06985 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Siah1bQ06985 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Siah1bQ06985 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Siah1bQ06985 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Siah1bQ06985 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Siah1bQ06985 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Siah1bQ06985 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Siah1bQ06985 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Siah1bQ06985 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Siah1bQ06985 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Siah1bQ06985 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Siah1bQ06985 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Siah1bQ06985 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Siah1bQ06985 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Siah1bQ06985 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Siah1bQ06985 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Siah1bQ06985 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Siah1bQ06985 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Siah1bQ06985 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Siah1bQ06985 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Siah1bQ06985 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Siah1bQ06985 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Siah1bQ06985 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Siah1bQ06985 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Siah1bQ06985 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Siah1bQ06985 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Siah1bQ06985 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Siah1bQ06985 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms