Protein–RNA interactions for Protein: Q06348

Prrx2, Paired mesoderm homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx2Q06348 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Prrx2Q06348 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms