Protein–RNA interactions for Protein: Q06138

Cab39, Calcium-binding protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39Q06138 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cab39Q06138 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cab39Q06138 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cab39Q06138 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cab39Q06138 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cab39Q06138 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cab39Q06138 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cab39Q06138 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cab39Q06138 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cab39Q06138 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cab39Q06138 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cab39Q06138 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cab39Q06138 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cab39Q06138 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cab39Q06138 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cab39Q06138 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Cab39Q06138 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cab39Q06138 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cab39Q06138 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Cab39Q06138 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cab39Q06138 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cab39Q06138 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cab39Q06138 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cab39Q06138 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cab39Q06138 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cab39Q06138 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Cab39Q06138 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cab39Q06138 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cab39Q06138 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cab39Q06138 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cab39Q06138 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cab39Q06138 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cab39Q06138 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cab39Q06138 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cab39Q06138 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cab39Q06138 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Cab39Q06138 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cab39Q06138 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cab39Q06138 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cab39Q06138 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cab39Q06138 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cab39Q06138 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cab39Q06138 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Cab39Q06138 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
Cab39Q06138 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Cab39Q06138 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Cab39Q06138 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Cab39Q06138 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cab39Q06138 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cab39Q06138 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cab39Q06138 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cab39Q06138 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cab39Q06138 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cab39Q06138 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cab39Q06138 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cab39Q06138 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cab39Q06138 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cab39Q06138 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cab39Q06138 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cab39Q06138 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cab39Q06138 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cab39Q06138 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cab39Q06138 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cab39Q06138 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cab39Q06138 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Cab39Q06138 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cab39Q06138 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cab39Q06138 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Cab39Q06138 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cab39Q06138 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cab39Q06138 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cab39Q06138 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cab39Q06138 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cab39Q06138 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cab39Q06138 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cab39Q06138 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cab39Q06138 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cab39Q06138 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cab39Q06138 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cab39Q06138 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cab39Q06138 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cab39Q06138 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cab39Q06138 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cab39Q06138 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cab39Q06138 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cab39Q06138 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cab39Q06138 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cab39Q06138 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cab39Q06138 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cab39Q06138 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cab39Q06138 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cab39Q06138 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cab39Q06138 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cab39Q06138 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cab39Q06138 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cab39Q06138 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cab39Q06138 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cab39Q06138 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Cab39Q06138 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Cab39Q06138 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms