Protein–RNA interactions for Protein: Q05793

Hspg2, Basement membrane-specific heparan sulfate proteoglycan core protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 3,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hspg2Q05793 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Hspg2Q05793 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Hspg2Q05793 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Hspg2Q05793 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Hspg2Q05793 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Hspg2Q05793 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Hspg2Q05793 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Hspg2Q05793 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Hspg2Q05793 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Hspg2Q05793 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Hspg2Q05793 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Hspg2Q05793 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Hspg2Q05793 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Hspg2Q05793 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Hspg2Q05793 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Hspg2Q05793 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Hspg2Q05793 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Hspg2Q05793 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Hspg2Q05793 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Hspg2Q05793 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Hspg2Q05793 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Hspg2Q05793 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Hspg2Q05793 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hspg2Q05793 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hspg2Q05793 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hspg2Q05793 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hspg2Q05793 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hspg2Q05793 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hspg2Q05793 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hspg2Q05793 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hspg2Q05793 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hspg2Q05793 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hspg2Q05793 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Hspg2Q05793 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Hspg2Q05793 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Hspg2Q05793 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Hspg2Q05793 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hspg2Q05793 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Hspg2Q05793 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hspg2Q05793 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hspg2Q05793 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hspg2Q05793 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hspg2Q05793 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hspg2Q05793 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hspg2Q05793 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hspg2Q05793 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hspg2Q05793 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hspg2Q05793 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hspg2Q05793 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hspg2Q05793 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hspg2Q05793 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hspg2Q05793 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hspg2Q05793 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hspg2Q05793 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hspg2Q05793 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hspg2Q05793 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hspg2Q05793 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hspg2Q05793 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hspg2Q05793 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Hspg2Q05793 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hspg2Q05793 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hspg2Q05793 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hspg2Q05793 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Hspg2Q05793 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hspg2Q05793 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hspg2Q05793 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hspg2Q05793 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hspg2Q05793 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hspg2Q05793 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hspg2Q05793 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hspg2Q05793 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Hspg2Q05793 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hspg2Q05793 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Hspg2Q05793 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Hspg2Q05793 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hspg2Q05793 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hspg2Q05793 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hspg2Q05793 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hspg2Q05793 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hspg2Q05793 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hspg2Q05793 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hspg2Q05793 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hspg2Q05793 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Hspg2Q05793 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hspg2Q05793 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Hspg2Q05793 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hspg2Q05793 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hspg2Q05793 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hspg2Q05793 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hspg2Q05793 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hspg2Q05793 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hspg2Q05793 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hspg2Q05793 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hspg2Q05793 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hspg2Q05793 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hspg2Q05793 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hspg2Q05793 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hspg2Q05793 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hspg2Q05793 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hspg2Q05793 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms