Protein–RNA interactions for Protein: Q04750

Top1, DNA topoisomerase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1Q04750 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Top1Q04750 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Top1Q04750 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Top1Q04750 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Top1Q04750 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Top1Q04750 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Top1Q04750 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Top1Q04750 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Top1Q04750 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Top1Q04750 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Top1Q04750 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Top1Q04750 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Top1Q04750 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Top1Q04750 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Top1Q04750 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Top1Q04750 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Top1Q04750 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Top1Q04750 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Top1Q04750 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Top1Q04750 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Top1Q04750 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Top1Q04750 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Top1Q04750 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Top1Q04750 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Top1Q04750 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Top1Q04750 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Top1Q04750 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Top1Q04750 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Top1Q04750 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Top1Q04750 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Top1Q04750 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Top1Q04750 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Top1Q04750 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Top1Q04750 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Top1Q04750 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Top1Q04750 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Top1Q04750 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Top1Q04750 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Top1Q04750 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Top1Q04750 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Top1Q04750 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Top1Q04750 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Top1Q04750 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Top1Q04750 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Top1Q04750 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Top1Q04750 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Top1Q04750 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Top1Q04750 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Top1Q04750 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Top1Q04750 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Top1Q04750 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Top1Q04750 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Top1Q04750 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Top1Q04750 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Top1Q04750 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Top1Q04750 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Top1Q04750 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Top1Q04750 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Top1Q04750 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Top1Q04750 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Top1Q04750 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Top1Q04750 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Top1Q04750 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Top1Q04750 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Top1Q04750 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Top1Q04750 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Top1Q04750 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Top1Q04750 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Top1Q04750 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Top1Q04750 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Top1Q04750 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Top1Q04750 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Top1Q04750 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Top1Q04750 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Top1Q04750 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Top1Q04750 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Top1Q04750 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Top1Q04750 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Top1Q04750 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Top1Q04750 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Top1Q04750 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Top1Q04750 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Top1Q04750 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Top1Q04750 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Top1Q04750 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Top1Q04750 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Top1Q04750 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Top1Q04750 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Top1Q04750 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Top1Q04750 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Top1Q04750 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Top1Q04750 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Top1Q04750 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Top1Q04750 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Top1Q04750 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Top1Q04750 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Top1Q04750 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Top1Q04750 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Top1Q04750 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Top1Q04750 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms