Protein–RNA interactions for Protein: Q02789

Cacna1s, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, mousemouse

Predictions only

Length 1,880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1sQ02789 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cacna1sQ02789 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cacna1sQ02789 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cacna1sQ02789 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cacna1sQ02789 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cacna1sQ02789 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cacna1sQ02789 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cacna1sQ02789 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cacna1sQ02789 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cacna1sQ02789 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cacna1sQ02789 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Cacna1sQ02789 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cacna1sQ02789 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cacna1sQ02789 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cacna1sQ02789 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cacna1sQ02789 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Cacna1sQ02789 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Cacna1sQ02789 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cacna1sQ02789 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cacna1sQ02789 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cacna1sQ02789 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Cacna1sQ02789 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cacna1sQ02789 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cacna1sQ02789 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cacna1sQ02789 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cacna1sQ02789 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cacna1sQ02789 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cacna1sQ02789 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cacna1sQ02789 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cacna1sQ02789 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cacna1sQ02789 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cacna1sQ02789 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cacna1sQ02789 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Cacna1sQ02789 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cacna1sQ02789 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cacna1sQ02789 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cacna1sQ02789 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cacna1sQ02789 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cacna1sQ02789 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cacna1sQ02789 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cacna1sQ02789 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cacna1sQ02789 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cacna1sQ02789 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cacna1sQ02789 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cacna1sQ02789 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cacna1sQ02789 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cacna1sQ02789 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cacna1sQ02789 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Cacna1sQ02789 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cacna1sQ02789 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cacna1sQ02789 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cacna1sQ02789 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cacna1sQ02789 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cacna1sQ02789 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cacna1sQ02789 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cacna1sQ02789 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Cacna1sQ02789 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cacna1sQ02789 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cacna1sQ02789 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cacna1sQ02789 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cacna1sQ02789 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cacna1sQ02789 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cacna1sQ02789 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cacna1sQ02789 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cacna1sQ02789 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cacna1sQ02789 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cacna1sQ02789 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cacna1sQ02789 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Cacna1sQ02789 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cacna1sQ02789 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cacna1sQ02789 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Cacna1sQ02789 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Cacna1sQ02789 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cacna1sQ02789 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cacna1sQ02789 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cacna1sQ02789 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cacna1sQ02789 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cacna1sQ02789 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cacna1sQ02789 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cacna1sQ02789 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cacna1sQ02789 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cacna1sQ02789 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cacna1sQ02789 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cacna1sQ02789 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cacna1sQ02789 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cacna1sQ02789 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cacna1sQ02789 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cacna1sQ02789 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cacna1sQ02789 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cacna1sQ02789 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cacna1sQ02789 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Cacna1sQ02789 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cacna1sQ02789 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cacna1sQ02789 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cacna1sQ02789 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cacna1sQ02789 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cacna1sQ02789 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Cacna1sQ02789 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cacna1sQ02789 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cacna1sQ02789 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms