Protein–RNA interactions for Protein: Q01887

Ryk, Tyrosine-protein kinase RYK, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RykQ01887 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RykQ01887 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RykQ01887 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RykQ01887 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RykQ01887 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RykQ01887 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RykQ01887 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RykQ01887 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RykQ01887 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RykQ01887 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RykQ01887 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RykQ01887 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RykQ01887 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RykQ01887 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RykQ01887 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RykQ01887 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RykQ01887 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RykQ01887 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RykQ01887 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RykQ01887 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RykQ01887 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RykQ01887 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RykQ01887 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
RykQ01887 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
RykQ01887 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RykQ01887 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RykQ01887 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RykQ01887 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RykQ01887 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RykQ01887 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RykQ01887 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RykQ01887 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RykQ01887 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RykQ01887 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RykQ01887 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RykQ01887 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RykQ01887 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RykQ01887 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RykQ01887 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RykQ01887 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RykQ01887 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RykQ01887 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RykQ01887 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RykQ01887 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RykQ01887 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RykQ01887 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RykQ01887 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RykQ01887 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RykQ01887 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RykQ01887 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RykQ01887 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RykQ01887 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RykQ01887 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RykQ01887 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RykQ01887 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
RykQ01887 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
RykQ01887 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RykQ01887 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RykQ01887 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RykQ01887 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RykQ01887 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RykQ01887 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RykQ01887 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RykQ01887 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RykQ01887 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RykQ01887 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RykQ01887 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RykQ01887 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RykQ01887 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RykQ01887 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RykQ01887 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RykQ01887 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RykQ01887 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RykQ01887 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RykQ01887 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RykQ01887 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RykQ01887 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RykQ01887 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RykQ01887 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RykQ01887 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RykQ01887 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RykQ01887 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
RykQ01887 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RykQ01887 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RykQ01887 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RykQ01887 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RykQ01887 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RykQ01887 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RykQ01887 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RykQ01887 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RykQ01887 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RykQ01887 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RykQ01887 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RykQ01887 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RykQ01887 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RykQ01887 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RykQ01887 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RykQ01887 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RykQ01887 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
RykQ01887 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.6 ms