Protein–RNA interactions for Protein: Q01853

Vcp, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VcpQ01853 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
VcpQ01853 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
VcpQ01853 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VcpQ01853 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VcpQ01853 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VcpQ01853 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VcpQ01853 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
VcpQ01853 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
VcpQ01853 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VcpQ01853 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VcpQ01853 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VcpQ01853 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
VcpQ01853 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VcpQ01853 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VcpQ01853 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VcpQ01853 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VcpQ01853 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VcpQ01853 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VcpQ01853 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VcpQ01853 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VcpQ01853 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VcpQ01853 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VcpQ01853 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VcpQ01853 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VcpQ01853 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VcpQ01853 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VcpQ01853 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VcpQ01853 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VcpQ01853 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VcpQ01853 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VcpQ01853 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VcpQ01853 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VcpQ01853 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VcpQ01853 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VcpQ01853 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VcpQ01853 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VcpQ01853 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VcpQ01853 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VcpQ01853 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VcpQ01853 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VcpQ01853 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VcpQ01853 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VcpQ01853 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VcpQ01853 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VcpQ01853 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VcpQ01853 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VcpQ01853 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VcpQ01853 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VcpQ01853 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VcpQ01853 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
VcpQ01853 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
VcpQ01853 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VcpQ01853 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VcpQ01853 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VcpQ01853 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VcpQ01853 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VcpQ01853 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VcpQ01853 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VcpQ01853 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VcpQ01853 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VcpQ01853 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VcpQ01853 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VcpQ01853 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VcpQ01853 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VcpQ01853 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VcpQ01853 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VcpQ01853 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VcpQ01853 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VcpQ01853 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VcpQ01853 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
VcpQ01853 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VcpQ01853 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VcpQ01853 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VcpQ01853 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VcpQ01853 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VcpQ01853 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VcpQ01853 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VcpQ01853 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VcpQ01853 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VcpQ01853 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
VcpQ01853 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VcpQ01853 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VcpQ01853 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VcpQ01853 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VcpQ01853 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
VcpQ01853 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VcpQ01853 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VcpQ01853 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
VcpQ01853 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VcpQ01853 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
VcpQ01853 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VcpQ01853 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VcpQ01853 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VcpQ01853 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VcpQ01853 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VcpQ01853 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VcpQ01853 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VcpQ01853 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VcpQ01853 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VcpQ01853 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms