Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EgfrQ01279 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EgfrQ01279 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EgfrQ01279 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EgfrQ01279 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
EgfrQ01279 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EgfrQ01279 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
EgfrQ01279 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EgfrQ01279 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
EgfrQ01279 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
EgfrQ01279 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
EgfrQ01279 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
EgfrQ01279 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
EgfrQ01279 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC17■□□□□ 0.31
EgfrQ01279 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC17■□□□□ 0.31
EgfrQ01279 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
EgfrQ01279 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
EgfrQ01279 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC17■□□□□ 0.31
EgfrQ01279 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EgfrQ01279 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EgfrQ01279 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EgfrQ01279 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
EgfrQ01279 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EgfrQ01279 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EgfrQ01279 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EgfrQ01279 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EgfrQ01279 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EgfrQ01279 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EgfrQ01279 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EgfrQ01279 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EgfrQ01279 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EgfrQ01279 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EgfrQ01279 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EgfrQ01279 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EgfrQ01279 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EgfrQ01279 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EgfrQ01279 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EgfrQ01279 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EgfrQ01279 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EgfrQ01279 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EgfrQ01279 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EgfrQ01279 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EgfrQ01279 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EgfrQ01279 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EgfrQ01279 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
EgfrQ01279 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EgfrQ01279 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EgfrQ01279 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
EgfrQ01279 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EgfrQ01279 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
EgfrQ01279 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EgfrQ01279 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
EgfrQ01279 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EgfrQ01279 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
EgfrQ01279 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EgfrQ01279 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EgfrQ01279 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EgfrQ01279 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EgfrQ01279 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EgfrQ01279 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
EgfrQ01279 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EgfrQ01279 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EgfrQ01279 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EgfrQ01279 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EgfrQ01279 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EgfrQ01279 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EgfrQ01279 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EgfrQ01279 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EgfrQ01279 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EgfrQ01279 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EgfrQ01279 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EgfrQ01279 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EgfrQ01279 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EgfrQ01279 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EgfrQ01279 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EgfrQ01279 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EgfrQ01279 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EgfrQ01279 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
EgfrQ01279 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
EgfrQ01279 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
EgfrQ01279 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EgfrQ01279 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EgfrQ01279 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EgfrQ01279 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EgfrQ01279 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EgfrQ01279 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EgfrQ01279 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
EgfrQ01279 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EgfrQ01279 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
EgfrQ01279 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
EgfrQ01279 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EgfrQ01279 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EgfrQ01279 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EgfrQ01279 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EgfrQ01279 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EgfrQ01279 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EgfrQ01279 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EgfrQ01279 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EgfrQ01279 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EgfrQ01279 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms