Protein–RNA interactions for Protein: Q01102

Selp, P-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelpQ01102 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SelpQ01102 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SelpQ01102 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SelpQ01102 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SelpQ01102 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SelpQ01102 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SelpQ01102 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SelpQ01102 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SelpQ01102 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SelpQ01102 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SelpQ01102 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SelpQ01102 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SelpQ01102 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SelpQ01102 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SelpQ01102 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SelpQ01102 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SelpQ01102 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SelpQ01102 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SelpQ01102 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SelpQ01102 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SelpQ01102 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SelpQ01102 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SelpQ01102 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SelpQ01102 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SelpQ01102 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SelpQ01102 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SelpQ01102 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SelpQ01102 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SelpQ01102 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SelpQ01102 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SelpQ01102 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SelpQ01102 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SelpQ01102 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SelpQ01102 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SelpQ01102 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SelpQ01102 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SelpQ01102 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SelpQ01102 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SelpQ01102 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SelpQ01102 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SelpQ01102 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SelpQ01102 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SelpQ01102 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SelpQ01102 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SelpQ01102 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SelpQ01102 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SelpQ01102 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SelpQ01102 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SelpQ01102 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SelpQ01102 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SelpQ01102 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SelpQ01102 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SelpQ01102 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SelpQ01102 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SelpQ01102 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
SelpQ01102 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SelpQ01102 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SelpQ01102 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SelpQ01102 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SelpQ01102 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SelpQ01102 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SelpQ01102 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SelpQ01102 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SelpQ01102 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SelpQ01102 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SelpQ01102 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SelpQ01102 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SelpQ01102 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SelpQ01102 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SelpQ01102 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SelpQ01102 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SelpQ01102 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SelpQ01102 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SelpQ01102 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SelpQ01102 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SelpQ01102 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SelpQ01102 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SelpQ01102 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SelpQ01102 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SelpQ01102 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SelpQ01102 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SelpQ01102 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SelpQ01102 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SelpQ01102 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SelpQ01102 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SelpQ01102 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SelpQ01102 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SelpQ01102 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SelpQ01102 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SelpQ01102 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SelpQ01102 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SelpQ01102 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SelpQ01102 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SelpQ01102 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SelpQ01102 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SelpQ01102 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SelpQ01102 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SelpQ01102 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SelpQ01102 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SelpQ01102 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms