Protein–RNA interactions for Protein: Q00560

Il6st, Interleukin-6 receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Il6stQ00560 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Il6stQ00560 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Il6stQ00560 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Il6stQ00560 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Il6stQ00560 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Il6stQ00560 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Il6stQ00560 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Il6stQ00560 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Il6stQ00560 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Il6stQ00560 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Il6stQ00560 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Il6stQ00560 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Il6stQ00560 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Il6stQ00560 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Il6stQ00560 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Il6stQ00560 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Il6stQ00560 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Il6stQ00560 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Il6stQ00560 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Il6stQ00560 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Il6stQ00560 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Il6stQ00560 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Il6stQ00560 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Il6stQ00560 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Il6stQ00560 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Il6stQ00560 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Il6stQ00560 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Il6stQ00560 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Il6stQ00560 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Il6stQ00560 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Il6stQ00560 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Il6stQ00560 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Il6stQ00560 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Il6stQ00560 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Il6stQ00560 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Il6stQ00560 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Il6stQ00560 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Il6stQ00560 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Il6stQ00560 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Il6stQ00560 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Il6stQ00560 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Il6stQ00560 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Il6stQ00560 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Il6stQ00560 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Il6stQ00560 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Il6stQ00560 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Il6stQ00560 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Il6stQ00560 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Il6stQ00560 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Il6stQ00560 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Il6stQ00560 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Il6stQ00560 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Il6stQ00560 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Il6stQ00560 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Il6stQ00560 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Il6stQ00560 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Il6stQ00560 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Il6stQ00560 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Il6stQ00560 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Il6stQ00560 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Il6stQ00560 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Il6stQ00560 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Il6stQ00560 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Il6stQ00560 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Il6stQ00560 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Il6stQ00560 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Il6stQ00560 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Il6stQ00560 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Il6stQ00560 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Il6stQ00560 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Il6stQ00560 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Il6stQ00560 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Il6stQ00560 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Il6stQ00560 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Il6stQ00560 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Il6stQ00560 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Il6stQ00560 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Il6stQ00560 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Il6stQ00560 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Il6stQ00560 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Il6stQ00560 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Il6stQ00560 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Il6stQ00560 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Il6stQ00560 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Il6stQ00560 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Il6stQ00560 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Il6stQ00560 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Il6stQ00560 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Il6stQ00560 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Il6stQ00560 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Il6stQ00560 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Il6stQ00560 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Il6stQ00560 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Il6stQ00560 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Il6stQ00560 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Il6stQ00560 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Il6stQ00560 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Il6stQ00560 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Il6stQ00560 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Il6stQ00560 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms