Protein–RNA interactions for Protein: Q00422

Gabpa, GA-binding protein alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabpaQ00422 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GabpaQ00422 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GabpaQ00422 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GabpaQ00422 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GabpaQ00422 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GabpaQ00422 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GabpaQ00422 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GabpaQ00422 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GabpaQ00422 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GabpaQ00422 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GabpaQ00422 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GabpaQ00422 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GabpaQ00422 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GabpaQ00422 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GabpaQ00422 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GabpaQ00422 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GabpaQ00422 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GabpaQ00422 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GabpaQ00422 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GabpaQ00422 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GabpaQ00422 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GabpaQ00422 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GabpaQ00422 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GabpaQ00422 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GabpaQ00422 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GabpaQ00422 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GabpaQ00422 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GabpaQ00422 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GabpaQ00422 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GabpaQ00422 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GabpaQ00422 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GabpaQ00422 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GabpaQ00422 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GabpaQ00422 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GabpaQ00422 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GabpaQ00422 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GabpaQ00422 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GabpaQ00422 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GabpaQ00422 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GabpaQ00422 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GabpaQ00422 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GabpaQ00422 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GabpaQ00422 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GabpaQ00422 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GabpaQ00422 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GabpaQ00422 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GabpaQ00422 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GabpaQ00422 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GabpaQ00422 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GabpaQ00422 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GabpaQ00422 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GabpaQ00422 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GabpaQ00422 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GabpaQ00422 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GabpaQ00422 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GabpaQ00422 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GabpaQ00422 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GabpaQ00422 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GabpaQ00422 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GabpaQ00422 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GabpaQ00422 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GabpaQ00422 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GabpaQ00422 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GabpaQ00422 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GabpaQ00422 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GabpaQ00422 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GabpaQ00422 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GabpaQ00422 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GabpaQ00422 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GabpaQ00422 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GabpaQ00422 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GabpaQ00422 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GabpaQ00422 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GabpaQ00422 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GabpaQ00422 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GabpaQ00422 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GabpaQ00422 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GabpaQ00422 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GabpaQ00422 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GabpaQ00422 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GabpaQ00422 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GabpaQ00422 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GabpaQ00422 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GabpaQ00422 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GabpaQ00422 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GabpaQ00422 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GabpaQ00422 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GabpaQ00422 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GabpaQ00422 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GabpaQ00422 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GabpaQ00422 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GabpaQ00422 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GabpaQ00422 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GabpaQ00422 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GabpaQ00422 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GabpaQ00422 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GabpaQ00422 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GabpaQ00422 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GabpaQ00422 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GabpaQ00422 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms