Protein–RNA interactions for Protein: P86448

Trim43b, Tripartite motif-containing protein 43B, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim43bP86448 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim43bP86448 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim43bP86448 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim43bP86448 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim43bP86448 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim43bP86448 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim43bP86448 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim43bP86448 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim43bP86448 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim43bP86448 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim43bP86448 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim43bP86448 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim43bP86448 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim43bP86448 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim43bP86448 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim43bP86448 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim43bP86448 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim43bP86448 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim43bP86448 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim43bP86448 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim43bP86448 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim43bP86448 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim43bP86448 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim43bP86448 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim43bP86448 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim43bP86448 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim43bP86448 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim43bP86448 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim43bP86448 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim43bP86448 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim43bP86448 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim43bP86448 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim43bP86448 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim43bP86448 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim43bP86448 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim43bP86448 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim43bP86448 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim43bP86448 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim43bP86448 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim43bP86448 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim43bP86448 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim43bP86448 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim43bP86448 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim43bP86448 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim43bP86448 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim43bP86448 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim43bP86448 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim43bP86448 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim43bP86448 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim43bP86448 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim43bP86448 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim43bP86448 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim43bP86448 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim43bP86448 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim43bP86448 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim43bP86448 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim43bP86448 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim43bP86448 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim43bP86448 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim43bP86448 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim43bP86448 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim43bP86448 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim43bP86448 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim43bP86448 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim43bP86448 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim43bP86448 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim43bP86448 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim43bP86448 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim43bP86448 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim43bP86448 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim43bP86448 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Trim43bP86448 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Trim43bP86448 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Trim43bP86448 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Trim43bP86448 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Trim43bP86448 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim43bP86448 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim43bP86448 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim43bP86448 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim43bP86448 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim43bP86448 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim43bP86448 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim43bP86448 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim43bP86448 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim43bP86448 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim43bP86448 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim43bP86448 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim43bP86448 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim43bP86448 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim43bP86448 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim43bP86448 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim43bP86448 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim43bP86448 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim43bP86448 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim43bP86448 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim43bP86448 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim43bP86448 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim43bP86448 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim43bP86448 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim43bP86448 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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