Protein–RNA interactions for Protein: P70671

Irf3, Interferon regulatory factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf3P70671 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Irf3P70671 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Irf3P70671 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Irf3P70671 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Irf3P70671 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Irf3P70671 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Irf3P70671 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Irf3P70671 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Irf3P70671 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Irf3P70671 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Irf3P70671 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Irf3P70671 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Irf3P70671 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Irf3P70671 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Irf3P70671 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Irf3P70671 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Irf3P70671 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Irf3P70671 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Irf3P70671 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Irf3P70671 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Irf3P70671 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Irf3P70671 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Irf3P70671 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Irf3P70671 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Irf3P70671 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Irf3P70671 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Irf3P70671 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Irf3P70671 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Irf3P70671 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Irf3P70671 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Irf3P70671 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Irf3P70671 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Irf3P70671 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Irf3P70671 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Irf3P70671 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Irf3P70671 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Irf3P70671 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Irf3P70671 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Irf3P70671 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Irf3P70671 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Irf3P70671 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Irf3P70671 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Irf3P70671 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Irf3P70671 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Irf3P70671 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Irf3P70671 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Irf3P70671 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Irf3P70671 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Irf3P70671 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Irf3P70671 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Irf3P70671 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Irf3P70671 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Irf3P70671 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Irf3P70671 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Irf3P70671 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Irf3P70671 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Irf3P70671 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Irf3P70671 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Irf3P70671 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Irf3P70671 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Irf3P70671 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Irf3P70671 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Irf3P70671 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Irf3P70671 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Irf3P70671 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Irf3P70671 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Irf3P70671 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Irf3P70671 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Irf3P70671 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Irf3P70671 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Irf3P70671 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Irf3P70671 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Irf3P70671 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Irf3P70671 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Irf3P70671 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Irf3P70671 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Irf3P70671 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Irf3P70671 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Irf3P70671 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Irf3P70671 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Irf3P70671 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Irf3P70671 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Irf3P70671 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Irf3P70671 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Irf3P70671 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Irf3P70671 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Irf3P70671 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Irf3P70671 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Irf3P70671 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Irf3P70671 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Irf3P70671 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Irf3P70671 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Irf3P70671 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Irf3P70671 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Irf3P70671 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Irf3P70671 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Irf3P70671 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Irf3P70671 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Irf3P70671 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Irf3P70671 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms