Protein–RNA interactions for Protein: P70399

Tp53bp1, TP53-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53bp1P70399 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tp53bp1P70399 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tp53bp1P70399 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Tp53bp1P70399 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tp53bp1P70399 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tp53bp1P70399 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tp53bp1P70399 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tp53bp1P70399 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tp53bp1P70399 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tp53bp1P70399 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Tp53bp1P70399 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tp53bp1P70399 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tp53bp1P70399 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tp53bp1P70399 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tp53bp1P70399 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tp53bp1P70399 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tp53bp1P70399 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tp53bp1P70399 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tp53bp1P70399 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tp53bp1P70399 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tp53bp1P70399 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tp53bp1P70399 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tp53bp1P70399 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tp53bp1P70399 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tp53bp1P70399 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Tp53bp1P70399 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tp53bp1P70399 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tp53bp1P70399 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tp53bp1P70399 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tp53bp1P70399 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tp53bp1P70399 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tp53bp1P70399 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tp53bp1P70399 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Tp53bp1P70399 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tp53bp1P70399 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
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Tp53bp1P70399 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Tp53bp1P70399 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tp53bp1P70399 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Tp53bp1P70399 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tp53bp1P70399 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Tp53bp1P70399 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tp53bp1P70399 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tp53bp1P70399 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tp53bp1P70399 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Tp53bp1P70399 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tp53bp1P70399 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tp53bp1P70399 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Tp53bp1P70399 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tp53bp1P70399 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tp53bp1P70399 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tp53bp1P70399 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tp53bp1P70399 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tp53bp1P70399 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tp53bp1P70399 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tp53bp1P70399 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tp53bp1P70399 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Tp53bp1P70399 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Tp53bp1P70399 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tp53bp1P70399 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tp53bp1P70399 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tp53bp1P70399 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tp53bp1P70399 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tp53bp1P70399 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Tp53bp1P70399 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tp53bp1P70399 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Tp53bp1P70399 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tp53bp1P70399 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tp53bp1P70399 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tp53bp1P70399 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tp53bp1P70399 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tp53bp1P70399 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tp53bp1P70399 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Tp53bp1P70399 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tp53bp1P70399 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tp53bp1P70399 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tp53bp1P70399 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tp53bp1P70399 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tp53bp1P70399 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tp53bp1P70399 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tp53bp1P70399 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tp53bp1P70399 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tp53bp1P70399 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tp53bp1P70399 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Tp53bp1P70399 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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