Protein–RNA interactions for Protein: P70338

Gfi1, Zinc finger protein Gfi-1, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfi1P70338 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gfi1P70338 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gfi1P70338 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gfi1P70338 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gfi1P70338 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gfi1P70338 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gfi1P70338 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gfi1P70338 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gfi1P70338 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gfi1P70338 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gfi1P70338 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gfi1P70338 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gfi1P70338 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gfi1P70338 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gfi1P70338 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gfi1P70338 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gfi1P70338 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gfi1P70338 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gfi1P70338 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gfi1P70338 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gfi1P70338 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gfi1P70338 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gfi1P70338 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gfi1P70338 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gfi1P70338 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gfi1P70338 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gfi1P70338 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gfi1P70338 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gfi1P70338 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gfi1P70338 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gfi1P70338 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gfi1P70338 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gfi1P70338 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gfi1P70338 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gfi1P70338 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gfi1P70338 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gfi1P70338 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gfi1P70338 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gfi1P70338 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gfi1P70338 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gfi1P70338 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gfi1P70338 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gfi1P70338 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gfi1P70338 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gfi1P70338 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gfi1P70338 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gfi1P70338 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gfi1P70338 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gfi1P70338 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gfi1P70338 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gfi1P70338 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gfi1P70338 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gfi1P70338 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gfi1P70338 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gfi1P70338 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gfi1P70338 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gfi1P70338 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gfi1P70338 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gfi1P70338 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gfi1P70338 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gfi1P70338 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gfi1P70338 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gfi1P70338 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gfi1P70338 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gfi1P70338 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gfi1P70338 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gfi1P70338 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gfi1P70338 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gfi1P70338 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gfi1P70338 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gfi1P70338 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gfi1P70338 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gfi1P70338 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gfi1P70338 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gfi1P70338 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gfi1P70338 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gfi1P70338 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gfi1P70338 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gfi1P70338 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gfi1P70338 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gfi1P70338 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gfi1P70338 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gfi1P70338 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gfi1P70338 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gfi1P70338 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gfi1P70338 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gfi1P70338 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gfi1P70338 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gfi1P70338 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gfi1P70338 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gfi1P70338 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gfi1P70338 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gfi1P70338 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gfi1P70338 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gfi1P70338 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gfi1P70338 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gfi1P70338 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gfi1P70338 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gfi1P70338 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gfi1P70338 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms