Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SbdsP70122 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SbdsP70122 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SbdsP70122 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SbdsP70122 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SbdsP70122 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SbdsP70122 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SbdsP70122 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SbdsP70122 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
SbdsP70122 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SbdsP70122 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SbdsP70122 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
SbdsP70122 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
SbdsP70122 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SbdsP70122 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SbdsP70122 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SbdsP70122 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SbdsP70122 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SbdsP70122 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SbdsP70122 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SbdsP70122 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SbdsP70122 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SbdsP70122 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SbdsP70122 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SbdsP70122 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SbdsP70122 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SbdsP70122 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SbdsP70122 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SbdsP70122 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SbdsP70122 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SbdsP70122 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SbdsP70122 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SbdsP70122 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SbdsP70122 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SbdsP70122 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SbdsP70122 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SbdsP70122 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SbdsP70122 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SbdsP70122 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SbdsP70122 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
SbdsP70122 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SbdsP70122 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
SbdsP70122 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SbdsP70122 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
SbdsP70122 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SbdsP70122 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SbdsP70122 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SbdsP70122 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SbdsP70122 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SbdsP70122 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SbdsP70122 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SbdsP70122 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
SbdsP70122 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SbdsP70122 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SbdsP70122 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SbdsP70122 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SbdsP70122 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SbdsP70122 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SbdsP70122 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
SbdsP70122 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
SbdsP70122 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SbdsP70122 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SbdsP70122 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SbdsP70122 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SbdsP70122 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SbdsP70122 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SbdsP70122 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
SbdsP70122 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SbdsP70122 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SbdsP70122 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SbdsP70122 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SbdsP70122 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SbdsP70122 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SbdsP70122 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SbdsP70122 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SbdsP70122 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SbdsP70122 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
SbdsP70122 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SbdsP70122 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SbdsP70122 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SbdsP70122 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SbdsP70122 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SbdsP70122 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SbdsP70122 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SbdsP70122 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SbdsP70122 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SbdsP70122 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SbdsP70122 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SbdsP70122 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SbdsP70122 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SbdsP70122 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SbdsP70122 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SbdsP70122 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SbdsP70122 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SbdsP70122 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SbdsP70122 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SbdsP70122 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SbdsP70122 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SbdsP70122 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SbdsP70122 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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