Protein–RNA interactions for Protein: P61406

Smg6, Telomerase-binding protein EST1A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg6P61406 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Smg6P61406 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Smg6P61406 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Smg6P61406 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Smg6P61406 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Smg6P61406 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Smg6P61406 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Smg6P61406 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Smg6P61406 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Smg6P61406 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Smg6P61406 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Smg6P61406 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Smg6P61406 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Smg6P61406 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Smg6P61406 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Smg6P61406 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Smg6P61406 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Smg6P61406 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Smg6P61406 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Smg6P61406 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Smg6P61406 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Smg6P61406 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Smg6P61406 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Smg6P61406 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Smg6P61406 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Smg6P61406 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Smg6P61406 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Smg6P61406 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Smg6P61406 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Smg6P61406 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Smg6P61406 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Smg6P61406 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Smg6P61406 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Smg6P61406 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Smg6P61406 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Smg6P61406 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Smg6P61406 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Smg6P61406 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Smg6P61406 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Smg6P61406 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Smg6P61406 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Smg6P61406 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Smg6P61406 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Smg6P61406 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Smg6P61406 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Smg6P61406 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Smg6P61406 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Smg6P61406 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Smg6P61406 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Smg6P61406 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Smg6P61406 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Smg6P61406 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Smg6P61406 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Smg6P61406 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Smg6P61406 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Smg6P61406 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Smg6P61406 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Smg6P61406 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Smg6P61406 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Smg6P61406 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Smg6P61406 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Smg6P61406 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Smg6P61406 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Smg6P61406 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Smg6P61406 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Smg6P61406 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Smg6P61406 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Smg6P61406 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Smg6P61406 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Smg6P61406 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Smg6P61406 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Smg6P61406 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Smg6P61406 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Smg6P61406 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Smg6P61406 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Smg6P61406 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Smg6P61406 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Smg6P61406 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Smg6P61406 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Smg6P61406 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Smg6P61406 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Smg6P61406 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Smg6P61406 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Smg6P61406 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Smg6P61406 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Smg6P61406 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Smg6P61406 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Smg6P61406 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Smg6P61406 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Smg6P61406 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Smg6P61406 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Smg6P61406 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Smg6P61406 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Smg6P61406 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Smg6P61406 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Smg6P61406 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Smg6P61406 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Smg6P61406 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Smg6P61406 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Smg6P61406 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms