Protein–RNA interactions for Protein: P60879

Snap25, Synaptosomal-associated protein 25, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap25P60879 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snap25P60879 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Snap25P60879 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snap25P60879 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snap25P60879 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snap25P60879 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snap25P60879 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snap25P60879 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snap25P60879 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snap25P60879 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snap25P60879 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Snap25P60879 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snap25P60879 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snap25P60879 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snap25P60879 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snap25P60879 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snap25P60879 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Snap25P60879 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Snap25P60879 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snap25P60879 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snap25P60879 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snap25P60879 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snap25P60879 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snap25P60879 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snap25P60879 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snap25P60879 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snap25P60879 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snap25P60879 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snap25P60879 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snap25P60879 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snap25P60879 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snap25P60879 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snap25P60879 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snap25P60879 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snap25P60879 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snap25P60879 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snap25P60879 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snap25P60879 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snap25P60879 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snap25P60879 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snap25P60879 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snap25P60879 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snap25P60879 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snap25P60879 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snap25P60879 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snap25P60879 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snap25P60879 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snap25P60879 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snap25P60879 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snap25P60879 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snap25P60879 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snap25P60879 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snap25P60879 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snap25P60879 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snap25P60879 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snap25P60879 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snap25P60879 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snap25P60879 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snap25P60879 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Snap25P60879 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Snap25P60879 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snap25P60879 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snap25P60879 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snap25P60879 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Snap25P60879 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Snap25P60879 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snap25P60879 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snap25P60879 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snap25P60879 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snap25P60879 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snap25P60879 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snap25P60879 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snap25P60879 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snap25P60879 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snap25P60879 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snap25P60879 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snap25P60879 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snap25P60879 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snap25P60879 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snap25P60879 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snap25P60879 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snap25P60879 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snap25P60879 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snap25P60879 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snap25P60879 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snap25P60879 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snap25P60879 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snap25P60879 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snap25P60879 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snap25P60879 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snap25P60879 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Snap25P60879 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snap25P60879 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snap25P60879 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snap25P60879 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snap25P60879 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snap25P60879 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snap25P60879 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snap25P60879 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snap25P60879 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms