Protein–RNA interactions for Protein: P58873

Rhbdl3, Rhomboid-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdl3P58873 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rhbdl3P58873 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Rhbdl3P58873 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rhbdl3P58873 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rhbdl3P58873 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rhbdl3P58873 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rhbdl3P58873 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rhbdl3P58873 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rhbdl3P58873 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rhbdl3P58873 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rhbdl3P58873 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Rhbdl3P58873 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rhbdl3P58873 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rhbdl3P58873 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rhbdl3P58873 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Rhbdl3P58873 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Rhbdl3P58873 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rhbdl3P58873 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rhbdl3P58873 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rhbdl3P58873 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rhbdl3P58873 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rhbdl3P58873 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rhbdl3P58873 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rhbdl3P58873 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rhbdl3P58873 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rhbdl3P58873 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rhbdl3P58873 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rhbdl3P58873 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rhbdl3P58873 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rhbdl3P58873 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rhbdl3P58873 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Rhbdl3P58873 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Rhbdl3P58873 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rhbdl3P58873 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rhbdl3P58873 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Rhbdl3P58873 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rhbdl3P58873 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rhbdl3P58873 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rhbdl3P58873 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Rhbdl3P58873 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rhbdl3P58873 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rhbdl3P58873 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rhbdl3P58873 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rhbdl3P58873 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rhbdl3P58873 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rhbdl3P58873 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rhbdl3P58873 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rhbdl3P58873 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rhbdl3P58873 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rhbdl3P58873 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rhbdl3P58873 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rhbdl3P58873 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rhbdl3P58873 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rhbdl3P58873 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rhbdl3P58873 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rhbdl3P58873 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rhbdl3P58873 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rhbdl3P58873 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rhbdl3P58873 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rhbdl3P58873 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Rhbdl3P58873 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rhbdl3P58873 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rhbdl3P58873 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rhbdl3P58873 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rhbdl3P58873 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rhbdl3P58873 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rhbdl3P58873 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rhbdl3P58873 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rhbdl3P58873 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Rhbdl3P58873 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rhbdl3P58873 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rhbdl3P58873 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rhbdl3P58873 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rhbdl3P58873 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Rhbdl3P58873 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rhbdl3P58873 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rhbdl3P58873 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rhbdl3P58873 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rhbdl3P58873 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rhbdl3P58873 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Rhbdl3P58873 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Rhbdl3P58873 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rhbdl3P58873 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rhbdl3P58873 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rhbdl3P58873 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rhbdl3P58873 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rhbdl3P58873 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rhbdl3P58873 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rhbdl3P58873 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rhbdl3P58873 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rhbdl3P58873 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Rhbdl3P58873 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Rhbdl3P58873 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rhbdl3P58873 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rhbdl3P58873 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rhbdl3P58873 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Rhbdl3P58873 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Rhbdl3P58873 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rhbdl3P58873 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rhbdl3P58873 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms