Protein–RNA interactions for Protein: P56818

Bace1, Beta-secretase 1, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bace1P56818 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bace1P56818 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bace1P56818 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bace1P56818 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bace1P56818 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bace1P56818 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bace1P56818 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bace1P56818 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Bace1P56818 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bace1P56818 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bace1P56818 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bace1P56818 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bace1P56818 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bace1P56818 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bace1P56818 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bace1P56818 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bace1P56818 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bace1P56818 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bace1P56818 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bace1P56818 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bace1P56818 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bace1P56818 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bace1P56818 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bace1P56818 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bace1P56818 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Bace1P56818 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bace1P56818 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bace1P56818 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bace1P56818 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bace1P56818 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bace1P56818 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Bace1P56818 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bace1P56818 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Bace1P56818 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bace1P56818 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bace1P56818 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bace1P56818 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bace1P56818 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bace1P56818 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bace1P56818 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bace1P56818 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bace1P56818 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bace1P56818 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bace1P56818 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bace1P56818 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bace1P56818 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bace1P56818 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bace1P56818 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bace1P56818 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bace1P56818 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bace1P56818 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bace1P56818 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bace1P56818 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bace1P56818 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bace1P56818 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bace1P56818 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bace1P56818 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bace1P56818 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bace1P56818 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bace1P56818 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bace1P56818 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Bace1P56818 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bace1P56818 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bace1P56818 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bace1P56818 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bace1P56818 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Bace1P56818 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Bace1P56818 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Bace1P56818 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bace1P56818 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Bace1P56818 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bace1P56818 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bace1P56818 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bace1P56818 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Bace1P56818 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bace1P56818 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bace1P56818 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bace1P56818 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bace1P56818 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bace1P56818 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bace1P56818 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bace1P56818 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bace1P56818 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bace1P56818 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bace1P56818 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bace1P56818 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bace1P56818 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bace1P56818 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bace1P56818 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bace1P56818 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bace1P56818 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bace1P56818 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bace1P56818 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bace1P56818 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bace1P56818 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Bace1P56818 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Bace1P56818 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Bace1P56818 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Bace1P56818 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Bace1P56818 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms