Protein–RNA interactions for Protein: P51944

Ccnf, Cyclin-F, mousemouse

Predictions only

Length 777 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnfP51944 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CcnfP51944 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CcnfP51944 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CcnfP51944 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CcnfP51944 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CcnfP51944 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CcnfP51944 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CcnfP51944 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CcnfP51944 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CcnfP51944 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CcnfP51944 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CcnfP51944 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
CcnfP51944 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
CcnfP51944 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CcnfP51944 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CcnfP51944 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CcnfP51944 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
CcnfP51944 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
CcnfP51944 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CcnfP51944 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
CcnfP51944 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CcnfP51944 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
CcnfP51944 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
CcnfP51944 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CcnfP51944 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
CcnfP51944 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CcnfP51944 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CcnfP51944 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CcnfP51944 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CcnfP51944 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CcnfP51944 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CcnfP51944 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CcnfP51944 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CcnfP51944 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CcnfP51944 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CcnfP51944 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CcnfP51944 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CcnfP51944 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CcnfP51944 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CcnfP51944 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CcnfP51944 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CcnfP51944 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CcnfP51944 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CcnfP51944 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CcnfP51944 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CcnfP51944 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CcnfP51944 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CcnfP51944 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CcnfP51944 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CcnfP51944 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CcnfP51944 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CcnfP51944 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CcnfP51944 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CcnfP51944 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CcnfP51944 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CcnfP51944 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CcnfP51944 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CcnfP51944 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CcnfP51944 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CcnfP51944 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CcnfP51944 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CcnfP51944 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CcnfP51944 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CcnfP51944 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CcnfP51944 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CcnfP51944 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CcnfP51944 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CcnfP51944 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CcnfP51944 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CcnfP51944 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CcnfP51944 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CcnfP51944 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CcnfP51944 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CcnfP51944 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CcnfP51944 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CcnfP51944 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CcnfP51944 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CcnfP51944 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CcnfP51944 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CcnfP51944 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CcnfP51944 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CcnfP51944 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CcnfP51944 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CcnfP51944 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CcnfP51944 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CcnfP51944 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CcnfP51944 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CcnfP51944 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CcnfP51944 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CcnfP51944 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CcnfP51944 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CcnfP51944 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CcnfP51944 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CcnfP51944 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CcnfP51944 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CcnfP51944 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CcnfP51944 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CcnfP51944 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CcnfP51944 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CcnfP51944 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
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