Protein–RNA interactions for Protein: P50636

Rnf19a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF19A, mousemouse

Predictions only

Length 840 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf19aP50636 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf19aP50636 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf19aP50636 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf19aP50636 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf19aP50636 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf19aP50636 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf19aP50636 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf19aP50636 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf19aP50636 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf19aP50636 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf19aP50636 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf19aP50636 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf19aP50636 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf19aP50636 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf19aP50636 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf19aP50636 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf19aP50636 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf19aP50636 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf19aP50636 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf19aP50636 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf19aP50636 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf19aP50636 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf19aP50636 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf19aP50636 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf19aP50636 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf19aP50636 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf19aP50636 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf19aP50636 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf19aP50636 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf19aP50636 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf19aP50636 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf19aP50636 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf19aP50636 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf19aP50636 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf19aP50636 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf19aP50636 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf19aP50636 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf19aP50636 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf19aP50636 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf19aP50636 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf19aP50636 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf19aP50636 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf19aP50636 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf19aP50636 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf19aP50636 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf19aP50636 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf19aP50636 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf19aP50636 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf19aP50636 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf19aP50636 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf19aP50636 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf19aP50636 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf19aP50636 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf19aP50636 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf19aP50636 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf19aP50636 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf19aP50636 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf19aP50636 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf19aP50636 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf19aP50636 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf19aP50636 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf19aP50636 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf19aP50636 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf19aP50636 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf19aP50636 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf19aP50636 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf19aP50636 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf19aP50636 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf19aP50636 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf19aP50636 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf19aP50636 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf19aP50636 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf19aP50636 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf19aP50636 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf19aP50636 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf19aP50636 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf19aP50636 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf19aP50636 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf19aP50636 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf19aP50636 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf19aP50636 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf19aP50636 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf19aP50636 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf19aP50636 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf19aP50636 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf19aP50636 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf19aP50636 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf19aP50636 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf19aP50636 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf19aP50636 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf19aP50636 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf19aP50636 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf19aP50636 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf19aP50636 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf19aP50636 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf19aP50636 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf19aP50636 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf19aP50636 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf19aP50636 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf19aP50636 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms