Protein–RNA interactions for Protein: P50405

Sftpb, Pulmonary surfactant-associated protein B, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpbP50405 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SftpbP50405 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SftpbP50405 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SftpbP50405 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SftpbP50405 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SftpbP50405 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SftpbP50405 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SftpbP50405 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SftpbP50405 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SftpbP50405 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SftpbP50405 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SftpbP50405 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SftpbP50405 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SftpbP50405 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SftpbP50405 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SftpbP50405 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SftpbP50405 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SftpbP50405 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SftpbP50405 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SftpbP50405 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SftpbP50405 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SftpbP50405 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SftpbP50405 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SftpbP50405 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SftpbP50405 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SftpbP50405 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SftpbP50405 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SftpbP50405 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SftpbP50405 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SftpbP50405 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SftpbP50405 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SftpbP50405 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SftpbP50405 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SftpbP50405 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SftpbP50405 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SftpbP50405 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SftpbP50405 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SftpbP50405 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SftpbP50405 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SftpbP50405 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SftpbP50405 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SftpbP50405 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SftpbP50405 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SftpbP50405 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SftpbP50405 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SftpbP50405 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SftpbP50405 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SftpbP50405 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SftpbP50405 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SftpbP50405 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SftpbP50405 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SftpbP50405 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SftpbP50405 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SftpbP50405 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SftpbP50405 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SftpbP50405 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SftpbP50405 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SftpbP50405 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SftpbP50405 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SftpbP50405 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SftpbP50405 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SftpbP50405 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SftpbP50405 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SftpbP50405 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SftpbP50405 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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SftpbP50405 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SftpbP50405 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SftpbP50405 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SftpbP50405 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SftpbP50405 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SftpbP50405 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SftpbP50405 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SftpbP50405 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SftpbP50405 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SftpbP50405 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SftpbP50405 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SftpbP50405 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SftpbP50405 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SftpbP50405 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SftpbP50405 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SftpbP50405 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SftpbP50405 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SftpbP50405 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SftpbP50405 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SftpbP50405 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SftpbP50405 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SftpbP50405 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SftpbP50405 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SftpbP50405 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SftpbP50405 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SftpbP50405 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SftpbP50405 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SftpbP50405 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SftpbP50405 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SftpbP50405 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SftpbP50405 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SftpbP50405 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SftpbP50405 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SftpbP50405 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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