Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmod1P49813 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmod1P49813 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmod1P49813 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmod1P49813 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmod1P49813 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmod1P49813 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmod1P49813 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmod1P49813 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmod1P49813 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmod1P49813 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmod1P49813 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmod1P49813 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmod1P49813 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmod1P49813 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmod1P49813 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmod1P49813 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmod1P49813 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmod1P49813 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmod1P49813 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmod1P49813 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmod1P49813 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmod1P49813 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmod1P49813 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmod1P49813 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmod1P49813 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmod1P49813 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmod1P49813 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmod1P49813 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmod1P49813 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmod1P49813 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmod1P49813 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmod1P49813 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmod1P49813 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmod1P49813 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmod1P49813 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmod1P49813 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmod1P49813 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmod1P49813 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmod1P49813 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmod1P49813 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmod1P49813 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmod1P49813 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmod1P49813 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmod1P49813 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmod1P49813 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmod1P49813 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmod1P49813 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmod1P49813 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmod1P49813 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmod1P49813 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmod1P49813 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmod1P49813 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmod1P49813 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmod1P49813 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmod1P49813 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmod1P49813 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmod1P49813 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmod1P49813 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmod1P49813 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmod1P49813 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmod1P49813 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmod1P49813 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmod1P49813 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmod1P49813 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmod1P49813 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmod1P49813 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmod1P49813 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmod1P49813 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmod1P49813 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmod1P49813 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmod1P49813 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmod1P49813 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmod1P49813 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmod1P49813 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmod1P49813 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmod1P49813 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmod1P49813 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmod1P49813 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmod1P49813 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmod1P49813 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmod1P49813 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmod1P49813 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmod1P49813 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmod1P49813 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmod1P49813 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmod1P49813 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmod1P49813 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmod1P49813 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmod1P49813 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmod1P49813 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmod1P49813 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmod1P49813 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmod1P49813 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmod1P49813 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmod1P49813 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmod1P49813 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmod1P49813 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmod1P49813 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tmod1P49813 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms