Protein–RNA interactions for Protein: P48787

Tnni3, Troponin I, cardiac muscle, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni3P48787 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnni3P48787 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnni3P48787 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnni3P48787 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnni3P48787 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tnni3P48787 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnni3P48787 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnni3P48787 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnni3P48787 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnni3P48787 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnni3P48787 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnni3P48787 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnni3P48787 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnni3P48787 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnni3P48787 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnni3P48787 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnni3P48787 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnni3P48787 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnni3P48787 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnni3P48787 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnni3P48787 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnni3P48787 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnni3P48787 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnni3P48787 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnni3P48787 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnni3P48787 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnni3P48787 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnni3P48787 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnni3P48787 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnni3P48787 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnni3P48787 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnni3P48787 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnni3P48787 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnni3P48787 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnni3P48787 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnni3P48787 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnni3P48787 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnni3P48787 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnni3P48787 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnni3P48787 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnni3P48787 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnni3P48787 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnni3P48787 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnni3P48787 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnni3P48787 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnni3P48787 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnni3P48787 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnni3P48787 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnni3P48787 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnni3P48787 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnni3P48787 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnni3P48787 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnni3P48787 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnni3P48787 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnni3P48787 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnni3P48787 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnni3P48787 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnni3P48787 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnni3P48787 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnni3P48787 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnni3P48787 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnni3P48787 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnni3P48787 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnni3P48787 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnni3P48787 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnni3P48787 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnni3P48787 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnni3P48787 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnni3P48787 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnni3P48787 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnni3P48787 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnni3P48787 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnni3P48787 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnni3P48787 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnni3P48787 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnni3P48787 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnni3P48787 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnni3P48787 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnni3P48787 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnni3P48787 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnni3P48787 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnni3P48787 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnni3P48787 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnni3P48787 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnni3P48787 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnni3P48787 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnni3P48787 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnni3P48787 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnni3P48787 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnni3P48787 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnni3P48787 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnni3P48787 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnni3P48787 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnni3P48787 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnni3P48787 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnni3P48787 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnni3P48787 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnni3P48787 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnni3P48787 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnni3P48787 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms