Protein–RNA interactions for Protein: P47806

Gli1, Zinc finger protein GLI1, mousemouse

Predictions only

Length 1,111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli1P47806 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gli1P47806 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gli1P47806 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gli1P47806 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gli1P47806 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gli1P47806 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gli1P47806 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gli1P47806 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Gli1P47806 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Gli1P47806 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gli1P47806 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gli1P47806 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gli1P47806 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gli1P47806 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Gli1P47806 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Gli1P47806 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gli1P47806 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Gli1P47806 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gli1P47806 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gli1P47806 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gli1P47806 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gli1P47806 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gli1P47806 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gli1P47806 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gli1P47806 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gli1P47806 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gli1P47806 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gli1P47806 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gli1P47806 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gli1P47806 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gli1P47806 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gli1P47806 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gli1P47806 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gli1P47806 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gli1P47806 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gli1P47806 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gli1P47806 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gli1P47806 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gli1P47806 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gli1P47806 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gli1P47806 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gli1P47806 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gli1P47806 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Gli1P47806 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gli1P47806 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gli1P47806 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gli1P47806 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gli1P47806 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gli1P47806 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gli1P47806 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gli1P47806 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Gli1P47806 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gli1P47806 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gli1P47806 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gli1P47806 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gli1P47806 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gli1P47806 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gli1P47806 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gli1P47806 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gli1P47806 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gli1P47806 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gli1P47806 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gli1P47806 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gli1P47806 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gli1P47806 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gli1P47806 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gli1P47806 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gli1P47806 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gli1P47806 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gli1P47806 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Gli1P47806 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gli1P47806 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gli1P47806 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gli1P47806 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gli1P47806 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gli1P47806 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gli1P47806 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gli1P47806 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gli1P47806 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gli1P47806 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gli1P47806 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gli1P47806 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gli1P47806 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gli1P47806 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gli1P47806 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gli1P47806 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gli1P47806 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gli1P47806 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Gli1P47806 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Gli1P47806 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gli1P47806 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gli1P47806 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gli1P47806 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gli1P47806 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Gli1P47806 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gli1P47806 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gli1P47806 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gli1P47806 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gli1P47806 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gli1P47806 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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