Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

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Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SrprbP47758 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SrprbP47758 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SrprbP47758 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SrprbP47758 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SrprbP47758 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SrprbP47758 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SrprbP47758 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SrprbP47758 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SrprbP47758 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SrprbP47758 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SrprbP47758 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SrprbP47758 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SrprbP47758 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SrprbP47758 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SrprbP47758 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SrprbP47758 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SrprbP47758 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SrprbP47758 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SrprbP47758 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SrprbP47758 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SrprbP47758 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SrprbP47758 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SrprbP47758 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SrprbP47758 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SrprbP47758 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SrprbP47758 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SrprbP47758 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SrprbP47758 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SrprbP47758 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SrprbP47758 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SrprbP47758 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SrprbP47758 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SrprbP47758 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SrprbP47758 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SrprbP47758 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SrprbP47758 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SrprbP47758 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SrprbP47758 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SrprbP47758 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SrprbP47758 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SrprbP47758 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SrprbP47758 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SrprbP47758 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SrprbP47758 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SrprbP47758 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SrprbP47758 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SrprbP47758 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SrprbP47758 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SrprbP47758 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SrprbP47758 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SrprbP47758 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SrprbP47758 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SrprbP47758 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SrprbP47758 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SrprbP47758 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SrprbP47758 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SrprbP47758 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SrprbP47758 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SrprbP47758 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SrprbP47758 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SrprbP47758 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SrprbP47758 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SrprbP47758 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SrprbP47758 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SrprbP47758 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SrprbP47758 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SrprbP47758 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SrprbP47758 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SrprbP47758 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SrprbP47758 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SrprbP47758 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SrprbP47758 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SrprbP47758 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SrprbP47758 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SrprbP47758 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SrprbP47758 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SrprbP47758 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SrprbP47758 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SrprbP47758 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SrprbP47758 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SrprbP47758 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SrprbP47758 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SrprbP47758 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SrprbP47758 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SrprbP47758 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SrprbP47758 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SrprbP47758 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SrprbP47758 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SrprbP47758 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SrprbP47758 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SrprbP47758 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SrprbP47758 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SrprbP47758 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SrprbP47758 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SrprbP47758 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SrprbP47758 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SrprbP47758 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SrprbP47758 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SrprbP47758 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
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