Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PtprkP35822 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PtprkP35822 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PtprkP35822 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PtprkP35822 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PtprkP35822 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PtprkP35822 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PtprkP35822 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PtprkP35822 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PtprkP35822 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PtprkP35822 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PtprkP35822 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PtprkP35822 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PtprkP35822 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PtprkP35822 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PtprkP35822 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PtprkP35822 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PtprkP35822 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PtprkP35822 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PtprkP35822 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PtprkP35822 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PtprkP35822 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PtprkP35822 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PtprkP35822 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PtprkP35822 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PtprkP35822 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PtprkP35822 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PtprkP35822 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PtprkP35822 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PtprkP35822 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PtprkP35822 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PtprkP35822 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PtprkP35822 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PtprkP35822 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PtprkP35822 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PtprkP35822 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PtprkP35822 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PtprkP35822 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PtprkP35822 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PtprkP35822 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PtprkP35822 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PtprkP35822 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PtprkP35822 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PtprkP35822 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PtprkP35822 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PtprkP35822 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PtprkP35822 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PtprkP35822 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PtprkP35822 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PtprkP35822 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PtprkP35822 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PtprkP35822 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PtprkP35822 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PtprkP35822 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PtprkP35822 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PtprkP35822 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PtprkP35822 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PtprkP35822 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PtprkP35822 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PtprkP35822 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PtprkP35822 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PtprkP35822 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PtprkP35822 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PtprkP35822 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PtprkP35822 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PtprkP35822 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PtprkP35822 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PtprkP35822 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PtprkP35822 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PtprkP35822 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PtprkP35822 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PtprkP35822 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PtprkP35822 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PtprkP35822 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PtprkP35822 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PtprkP35822 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PtprkP35822 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PtprkP35822 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PtprkP35822 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PtprkP35822 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PtprkP35822 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PtprkP35822 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PtprkP35822 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PtprkP35822 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PtprkP35822 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PtprkP35822 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PtprkP35822 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PtprkP35822 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PtprkP35822 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PtprkP35822 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PtprkP35822 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PtprkP35822 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PtprkP35822 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PtprkP35822 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PtprkP35822 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PtprkP35822 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PtprkP35822 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PtprkP35822 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PtprkP35822 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PtprkP35822 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms