Protein–RNA interactions for Protein: P35235

Ptpn11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn11P35235 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptpn11P35235 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptpn11P35235 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptpn11P35235 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptpn11P35235 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptpn11P35235 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptpn11P35235 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptpn11P35235 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptpn11P35235 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptpn11P35235 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptpn11P35235 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptpn11P35235 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptpn11P35235 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptpn11P35235 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptpn11P35235 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptpn11P35235 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptpn11P35235 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptpn11P35235 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptpn11P35235 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptpn11P35235 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptpn11P35235 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptpn11P35235 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ptpn11P35235 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptpn11P35235 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptpn11P35235 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptpn11P35235 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptpn11P35235 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptpn11P35235 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptpn11P35235 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptpn11P35235 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptpn11P35235 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptpn11P35235 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptpn11P35235 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptpn11P35235 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptpn11P35235 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptpn11P35235 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptpn11P35235 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptpn11P35235 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptpn11P35235 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptpn11P35235 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptpn11P35235 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptpn11P35235 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptpn11P35235 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptpn11P35235 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptpn11P35235 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptpn11P35235 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptpn11P35235 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptpn11P35235 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptpn11P35235 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptpn11P35235 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptpn11P35235 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptpn11P35235 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptpn11P35235 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptpn11P35235 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptpn11P35235 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptpn11P35235 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptpn11P35235 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptpn11P35235 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptpn11P35235 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptpn11P35235 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptpn11P35235 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptpn11P35235 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ptpn11P35235 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptpn11P35235 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptpn11P35235 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptpn11P35235 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptpn11P35235 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptpn11P35235 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptpn11P35235 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptpn11P35235 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptpn11P35235 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptpn11P35235 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptpn11P35235 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptpn11P35235 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptpn11P35235 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptpn11P35235 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptpn11P35235 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptpn11P35235 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptpn11P35235 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptpn11P35235 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptpn11P35235 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptpn11P35235 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptpn11P35235 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptpn11P35235 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptpn11P35235 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptpn11P35235 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptpn11P35235 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptpn11P35235 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptpn11P35235 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptpn11P35235 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptpn11P35235 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptpn11P35235 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptpn11P35235 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptpn11P35235 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptpn11P35235 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptpn11P35235 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptpn11P35235 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptpn11P35235 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptpn11P35235 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ptpn11P35235 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms