Protein–RNA interactions for Protein: P30999

Ctnnd1, Catenin delta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnd1P30999 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctnnd1P30999 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctnnd1P30999 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctnnd1P30999 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctnnd1P30999 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctnnd1P30999 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctnnd1P30999 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctnnd1P30999 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctnnd1P30999 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctnnd1P30999 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctnnd1P30999 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctnnd1P30999 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctnnd1P30999 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctnnd1P30999 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctnnd1P30999 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctnnd1P30999 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctnnd1P30999 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctnnd1P30999 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctnnd1P30999 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctnnd1P30999 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctnnd1P30999 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctnnd1P30999 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctnnd1P30999 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctnnd1P30999 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctnnd1P30999 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctnnd1P30999 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctnnd1P30999 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctnnd1P30999 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctnnd1P30999 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctnnd1P30999 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctnnd1P30999 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctnnd1P30999 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctnnd1P30999 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctnnd1P30999 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctnnd1P30999 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctnnd1P30999 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctnnd1P30999 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctnnd1P30999 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctnnd1P30999 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctnnd1P30999 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctnnd1P30999 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctnnd1P30999 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctnnd1P30999 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctnnd1P30999 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctnnd1P30999 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctnnd1P30999 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctnnd1P30999 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctnnd1P30999 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctnnd1P30999 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctnnd1P30999 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctnnd1P30999 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctnnd1P30999 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctnnd1P30999 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctnnd1P30999 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctnnd1P30999 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctnnd1P30999 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctnnd1P30999 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctnnd1P30999 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctnnd1P30999 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctnnd1P30999 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctnnd1P30999 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctnnd1P30999 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ctnnd1P30999 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ctnnd1P30999 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ctnnd1P30999 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctnnd1P30999 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctnnd1P30999 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctnnd1P30999 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctnnd1P30999 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctnnd1P30999 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctnnd1P30999 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctnnd1P30999 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctnnd1P30999 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctnnd1P30999 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctnnd1P30999 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctnnd1P30999 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctnnd1P30999 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctnnd1P30999 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctnnd1P30999 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctnnd1P30999 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctnnd1P30999 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctnnd1P30999 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctnnd1P30999 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctnnd1P30999 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctnnd1P30999 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctnnd1P30999 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctnnd1P30999 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctnnd1P30999 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctnnd1P30999 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctnnd1P30999 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctnnd1P30999 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctnnd1P30999 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctnnd1P30999 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctnnd1P30999 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ctnnd1P30999 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnnd1P30999 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnnd1P30999 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnnd1P30999 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnnd1P30999 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ctnnd1P30999 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms